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CUPSAT公司

swMATH ID: 16877
软件作者: Vijaya Parthiban、M.Michael Gromiha、Dietmar Schomburg
描述: CUPSAT:预测点突变后的蛋白质稳定性。CUPSAT(科隆大学蛋白质稳定性分析工具)是一个网络工具,用于分析和预测点突变(单氨基酸突变)时蛋白质稳定性的变化。该程序使用结构环境特定的原子势和扭角势来预测ΔΔG,即野生型和突变型蛋白质去折叠自由能的差异。它需要蛋白质数据库格式的蛋白质结构和突变残基的位置。输出包括关于突变位点、其结构特征(溶剂可及性、二级结构和扭转角)的信息,以及关于特定氨基酸突变的19个可能取代的蛋白质稳定性变化的综合信息。此外,它还分析了突变氨基酸适应观察到的扭转角的能力。对1538个热变性突变和1603个化学变性突变进行了测试。为了确保预测方法的可靠性、准确性和可转移性,进行了几项验证测试(分样、刀切和k折),得出>80
主页: http://nar.oxfordjournals.org/content/34/suppl_2/W239.short
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