pKNOT公司 swMATH ID: 16874 软件作者: Lai Yan Long、Shih-Chung Yen、Sung-Huan Yu、Jenn-Kang Hwang 描述: pKNOT:蛋白质KNOT网络服务器。近年来,由于蛋白质数据库(PDB)中结构数量的巨大增长,结蛋白更为常见。研究表明,结区有助于蛋白质中的配体结合和酶活性,例如光敏色素的生色团结合域、酮酸还原异构酶或SpoU甲基转移酶。然而,由于普通生物学家缺乏方便的网络工具,文献中仍有许多错误识别的结。在这里,我们介绍了第一个检测蛋白质中的结并提供PDB-中的结蛋白信息的网络服务器——蛋白质结(pKNOT)网络服务器。在pKNOT中,用户可以输入PDB ID或以PDB格式上传蛋白质坐标。pKNOT网络服务器将使用泰勒平滑算法检测蛋白质中的结。所有检测到的结都可以使用基于Java的3D图形查看器进行视觉检查。我们相信pKNOT网络服务器对生物学家和结构生物学家都很有用。 主页: http://nar.oxfordjournals.org/content/35/suppl_2/W420.short 相关软件: LassoProt公司;链接保护;皮拉索;KnotProt公司;剂量;阿波罗;DBAli工具;MATRAS公司;NUCPLOT公司;LIGPLOT公司;EMBOS公司;焦耳(Jmol);PhenomeNET公司;智能GO;Ontobee公司;FUNC公司;阿伯OWL;工厂TFDB;鸡蛋NOG;ELM公司 引用于: 3文件 全部的 前5名7位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 1 大卫·马伦佐 1 克里斯蒂安·米歇莱蒂 1 奥兰迪尼,恩佐 1 乔安娜·I·苏·考斯卡。 1 彼得·苏·考斯基(Piotr Sułkowski) 2篇连载文章中引用 1 物理报告 1 分子生物学方法 在4个字段中引用 三 生物学和其他自然科学(92-XX) 2 流形和细胞复合体(57至XX) 2 统计力学,物质结构(82-XX) 1 统计学(62-XX) 按年份列出的引文