雷普纳

repRNA:产生RNA序列各种特征向量的网络服务器。随着后基因组时代RNA序列的快速增长,人们迫切需要开发一种灵活的方法,通过聚焦不同的特征来生成各种载体来表达这些序列。这是因为几乎所有现有的机器学习方法,如支持向量机(SVM)和KNN(k-最近邻)只能处理向量,而不能处理序列。为了满足日益增长的需求和加快基因组分析的速度,我们开发了一个新的web服务器,称为“RNA序列表示”(repRNA)。与现有的方法相比,repRNA具有更全面、更灵活、更强大的特点:(1)它可以生成11种不同模式的特征向量,供用户根据自己的调查目的进行选择;(2) 它允许用户从22个内置的理化性质中选择特征,甚至是用户自己定义的特征;(3)可以可视化生成的特征向量和相应RNA序列的二级结构。公众可通过http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/repRNA/免费访问repRNA网络服务器。