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阿卡普雷德

swMATH ID: 16757
软件作者: 郝琳;魏晨;丁慧
描述: AcalPred:一种基于序列的工具,用于区分酸性和碱性酶。酶的结构和活性受环境pH值的影响。虽然许多酶在pH值为6到8的范围内都能很好地工作,但一些特定的酶只有在酸性(pH<5)或碱性(pH>9)溶液中才有很好的效率。研究表明,酶的活性与其一级序列相关。从氨基酸序列判断酶对酸性或碱性环境的适应性在分子机制的阐明和高效酶的设计中至关重要。在这项研究中,我们开发了一种基于序列的方法来区分酸性酶和碱性酶。利用方差分析选择由g-gap二肽组成的最佳鉴别特征。并利用支持向量机建立了预测模型。在严格的折刀交叉验证中,总准确度为96.7
主页: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0075726
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