天蓬

雨篷包R。一种统计框架和计算程序,用于识别肿瘤内的亚群,确定每个亚群的突变谱,并推断肿瘤的系统发育史。输入是体细胞单核苷酸改变(SNA)的变异等位基因频率(VAF),以及肿瘤和匹配正常样本之间的等位基因特异性覆盖率(CNA)。这些数量可以直接从现有软件的输出中获取。Canopy提供了一个通用的数学框架,用于跨样本和站点汇集数据,以推断底层参数。对于属于CNA区域的sna,冠层推断它们的时间顺序并解析它们的相位。当存在多个与数据一致的进化构型时,冠层输出所有构型及其置信度。

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