PUS-赖氨酸

pSU-LYS:用PseAAC和集合随机森林方法预测蛋白质中赖氨酸琥珀酰化位点。蛋白质赖氨酸琥珀酰化是一种翻译后修饰(PTMS),在调节生物过程的多样性方面具有重要意义。然而,它也与一些疾病有关。因此,从基础研究和药物开发两个角度来看,我们面临着一个具有挑战性的问题:对于一个未知的蛋白质序列,其中有许多赖氨酸残基,哪些可以被琥珀酰化,哪些不能被琥珀酰化?为了解决这个问题,我们已经开发了一种称为pSuc Lys的预测器(1),将序列耦合的信息合并到一般的伪氨基酸组成中,(2)通过随机抽样平衡倾斜的训练数据集,和(3)通过融合一系列单独的随机森林分类器来构造集合预报器。严格的交叉验证表明,它明显优于现有的方法。在URL上建立了一个用户友好的PUC LYS Web服务器。HTTP://www. jCI-BioFi.CN/PUSC-LYS},用户可以在不需要经过复杂的数学方程的情况下容易地获得期望的结果。我们没有注意到,这里提出的公式和方法也可以用来分析计算蛋白质组学中的许多其他问题。


ZBMaX中的参考文献(31篇)1标准条款

显示结果1至20的31。
按年份排序(引文
  1. Adilina,谢赫;法里德,DeWangMD;Shatabda,SkkkHar:利用Chou PseAAC(2019)的关键特征预测有效的DNA结合蛋白预测
  2. 艾哈迈德,贾马尔;HayAT,MqSOOD:MFSC:基于Couth-PaSac分量的一般形式的高尔基蛋白质分类的多投票特征选择(2019)
  3. 侯赛因,Waqar;可汗,Yaser Daanial;RasooL,NuMman;可汗,Sher Afzal;Chou,Posi::A:基于序列的基于5步规则和一般α的蛋白质模型,用于识别蛋白质中的S-异戊烯基化位点(2019)
  4. 贾,Jianhua;李,Xiaoyan;邱,万仁;萧,Xuan;Chou,Chou:(CGR):将混沌游戏表示结合到PASAAC(2019)中识别蛋白质-蛋白质相互作用
  5. 可汗,Yaser Daanial;Jamil,Mehreen;侯赛因,Waqar;RasooL,Onman;可汗,Pix:Y:PssBosi-PaSaCac:PISAAC和统计矩的结合预测二硫键结合位点(2019)
  6. 卢,Fuhua;朱,茅舒;林,应;钟,Hongbin;蔡,雷;He,Pig;Y.,Y:CTLA-4-Ig治疗狼疮性肾炎的初步疗效评价。
  7. 宁,Qiao;马,支强;赵,肖伟:Dforml(KNN)-PISAAC:利用K的最近邻算法通过Chou的5步规则和伪分量检测蛋白质序列中的甲酰化位点(2019)
  8. 潘,Yi;王,Shiyuan;张,齐;卢,Qianzi;Su,东青;左,永春;杨,雷:各种Chou伪组分和还原氨基酸组成的动物毒素分析和预测(2019)
  9. 庆,杨;沧智,贾;桃英,李:基于稀疏自编码特征提取和集成分类器的适体蛋白相互作用对预测(2019)
  10. Mahapatra,Rajani Kanta:通过分子模拟、对接和动力学对恶性疟原虫CDPK5蛋白的文本分析(2019)
  11. Tahir,穆罕默德;Tayya,Helal.;Chong,KILTO:iRNA PseKNC(2-甲基):通过卷积神经网络和Chou伪成分识别RNA 2’-O-甲基化位点(2019)
  12. 王,Lidong;张,Ruijun;穆,亚双:Fu SulfPred:通过Chou将军PseAAC(2019)融合森林来鉴定蛋白质S-磺基化位点
  13. 赵,Xiaowei;张,叶;宁,Qiao;张,洪瑞;冀,Jinchao;尹,明浩:用粒子群优化算法优化极值提升系统识别N(^ 6)-甲基腺苷位点(2019)
  14. ARIF,穆罕默德;HayAT,Maqsood;J.ZaHoo:IMEM-2LSAAC:通过将SAAC的概念扩展到Chou的伪氨基酸组成(2018)来区分膜蛋白及其类型的两级模型
  15. 程,Xiang;萧,Xuan;Chou,阔晨:PLOCHI-BAL-MGNEG:拟平衡训练数据集和普通PseAAC(2018)预测革兰氏阴性细菌蛋白的亚细胞定位
  16. 贾,苍志;杨,庆;祖河,Quan:NuCuPoReD:通过一般PseKNC的四种不同模式预测物种特异性基因组核小体定位(2018)
  17. 鞠,哲;王,Shi Yun:利用MRMR特征选择和模糊支持向量机算法预测硫磺酰化位点(2018)
  18. 梅,胡安;傅,Yi;赵,冀:用特征选择和Chou一般伪氨基酸组成分析和预测离子通道抑制剂(2018)
  19. Sankari,E. Siva,Manimegalai,D.:通过将一个新的特征集纳入Chou的一般PseAAC(2018)预测膜蛋白类型
  20. 斯里瓦斯塔瓦,Abhishikha;库马尔,拉文德拉;库马尔,曼尼什:BLAPREST:预测和分类(β)-内酰胺酶使用Chou Chou PseAAC(2018)的三层预测系统

进一步的出版物可以在:HTTP://www. jCI-BioFi.CN/pSU-Lys/pSuxLys.CITIA.HTML.