传记作家

传记作家:数学生物学中图表理论模式,测量和分析的可视化。图论为当代生物学的许多领域提供了数学洞察力,如基因组学、代谢组学、生态学、进化论、生物化学等,因为它提供了一种高度直观和易于理解的模式、过程和产品的表示,用于检验因果假设。因此,需要大量的图论可视化工具,使生物学家能够方便地输入数据,与现有数据库交互,并生成各种不同的图形布局。BioGrapher是Graphviz图形可视化库和软件包的通用Excel前端,我们为探索性、体验性数学(Estive)收集贡献了生物Excel模拟和工具,可在线访问url{www.bioquest.org/espect}。虽然有许多优秀的独立应用程序,其中包括针对不同平台和操作系统的Graphviz,但BioGrapher的独特之处在于,它符合作为其一部分的Estive套件的最佳实践标准,它使用标准和无处不在的Excel环境作为前端和图形用户界面。它使用Excel电子表格的行和列范例实现了指定为标准邻接矩阵的图形(节点和边)的可视化,节点之间的连接由适当行和列的非零(非空)单元格值表示。一个完整的visualbasicforapplications(VBA)Excel界面已经编程并实现为一个附加的自定义菜单栏菜单,具有足够的功能,用户可以调用许多图形绘图和操作例程。在此,我们将详细介绍Excel应用程序(适用于macosx和mswindows7/8)及其在数学生物学问题解决中的应用。具体地说,我们将食物网的细节作为生物网络的典型例子,它可能显示出与小世界网络相关的特性和特征。一个算法方法使用图论,传记,和互补的JavaBENZER应用程序生成区间图演示。

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