藻簇 swMATH ID: 15971 软件作者： 陈伟晨、卡林·多曼 描述： R包phyclust。系统发育聚类（phyloclustering）是一种基于进化连续时间马尔可夫链模型的方法，用于从分子数据中识别种群结构，而无需假设连锁平衡。phyclust包（Chen 2011）为DNA和SNP数据提供了一个方便的phyloclustering实现，能够将个体聚类为亚群，并识别代表这些亚群的分子序列。它是用C语言设计的，用于性能，与R接口用于可视化，并集成了其他流行的开源程序，包括ms（Hudson 2002）、seq-gen（Rambaut和Grassly 1997）、Hap-Clustering（Tzeng 2005）和PAML-baseml（Yang 19972007），用于模拟数据、附加分析和搜索最佳树。有关更多信息、文档和示例，请参阅phyclust网站。 主页： https://cran.r-project.org/web/packages/phyclust/index.html 源代码： https://github.com/cran/phyclust网站 依赖项： 对 关键词： CRAN（起重机）;R包;系统发育聚类;植物聚类 相关软件： 对;蜘蛛;麦克鲁斯特;CRAN任务视图;水疗中心;HD等级;背景毫米 引用于： 0个文档