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跟踪器2

swMATH ID: 15710
软件作者: 沃尔夫冈·奥托;彼得·斯塔德勒(Peter F.Stadler)。;索尼娅·普罗哈斯卡。
描述: Tracker2-对齐一致性和足迹检测:系统发育足迹和一致的局部对齐集。从局部成对比对的集合中构建替代局部多序列比对的问题自然出现在系统发育足迹中,这是一种通过比较序列分析来识别调控元件的技术。基于对问题的理论讨论,我们设计了一个有效的启发式算法,并为此任务引入了软件工具跟踪器2。对生物数据和随机数据的测试表明,启发式算法在非常短的运行时间内产生了出色的结果。
主页: http://www.bioinf.uni-leipzig.de/~wolfgang/data/software/tracker2/
关键词: 对齐一致性;系统发育足迹;组合优化;跟踪器2
相关软件: T-咖啡;DIALIGN公司;探针Cons;爆炸;PSI-爆炸;Clustal X公司;肌肉;MAFFT公司;模因;菲洛吉布斯
引用于: 2文件

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