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泊松塞克

swMATH编号: 15335
软件作者: 李军(Jun Li)
描述: R包PoissonSeq:基于泊松对数线性模型的测序数据显著性分析。该软件包实现了一种对RNA测序数据进行归一化、测试和错误发现率估计的方法。该方法的描述见Li J、Witten DM、Johnstone I和Tibshirani R(2012)。RNA测序数据的归一化、测试和错误发现率估计。生物统计学13(3):523-38。我们使用一种基于泊松优良度统计的新方法估计实验的排序深度,基于泊松对数线性模型计算得分统计,然后使用改进的置换插件方法估计错误发现率。有关更详细的说明和示例数据,请访问http://www.stanford.edu网站/junli07/research.html。在这个版本中,我们更改了计算两类数据的日志foldchange的方法。FDR估算部分保持不变。
主页: https://cran.r-project.org/web/packages/PoissonSq/index.html
源代码:  https://github.com/cran/PoissonSeq网站
依赖项: R(右)
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