沉着

SimPed:一个模拟程序,为系谱结构生成单倍型和基因型数据。随着SNP基因型数据的广泛获得,对家系单倍型数据的分析引起了极大的兴趣。微卫星标记的标记间连锁不平衡通常较低,因为它们的物理距离较远;然而,对于SNP标记的密集图谱,标记位点之间可能存在强烈的连锁不平衡。连锁分析(参数和非参数)和基于家族的关联研究目前正在使用SNP标记位点的密集图谱进行。montecarlo方法通常用于连锁和关联研究;然而,到目前为止,还没有可用的程序可以生成由大量位点组成的单倍型和/或基因型数据。SimPed是一个程序,它可以为几乎任何规模和复杂度的系谱快速生成单倍型和/或基因型数据。对于超过20000个双列或多等位基因座,可以产生连锁不平衡或平衡的标记数据。单倍型和/或基因型是利用特定的遗传图谱距离和单倍型和/或等位基因频率为谱系结构生成的。SimPed产生的模拟数据有多种用途,包括估计系谱数据的单倍型频率的评估方法,评估因市场间连锁不平衡而导致的I型错误,以及估计连锁和基于家族的关联研究的经验p值。

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zbMATH参考文献(参考

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