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深度选取器

swMATH ID: 14943
软件作者: 王峰、龚慧超、刘高超、李美静、严创业、田霞、李学明、曾建阳
描述: DeepPicker:Cryo-EM中全自动粒子拾取的深度学习方法。粒子拾取在单粒子分析中是一个耗时的步骤,通常需要用户的大量干预,这已成为未来自动电子低温显微镜(Cryo-EM)的瓶颈。在这里,我们报告了一个名为DeepPicker的深度学习框架,以解决这个问题,并填补目前在全自动冷冻EM管道方面的空白。DeepPicker采用了一种新颖的跨分子训练策略,从先前分析的显微照片中捕获粒子的共同特征,因此在粒子拾取过程中不需要任何人为干预。对三个复合体最近发布的低温电子显微镜数据的测试表明,我们的基于深度学习的方案可以成功地完成人类水平的粒子拾取过程,并识别出足够数量的粒子,这些粒子可以与人类专家手动操作的粒子相媲美。这些结果表明,DeepPicker可以提供一种实用的工具,显著减少单粒子分析所花费的时间和手动工作,从而大大促进高分辨率低温电子显微镜结构的测定。
主页: http://arxiv.org/abs/1605.01838
相关软件: crYOLO公司;RELION公司;cisTEM公司;冷冻SPARC;EMan公司;签名;CTFFIND公司;向往;奇梅拉;FINUFFT公司;法语;TMaCS公司;倾斜拾音器;EMPIAR公司;运动Cor2;MAPPOS公司;Leginon公司;IMAGIC公司
引用于: 3文件

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