LTR索引 swMATH ID: 13196 软件作者： Z.Xu、H.Wang 描述： LTR_FINDER：预测全长LTR反转录转座子的有效工具。长末端重复逆转录转座子（LTR元件）是普遍存在的真核转座元件。它们在基因和基因组的进化中起着重要作用。许多生物基因组序列的不断增长给快速鉴定它们带来了巨大挑战。这是研究其结构、分布、功能和其他生物影响的第一步，也是必不可少的一步。然而，直到今天，高效发现LTR逆转录转座子的工具仍然非常有限。因此，我们开发了LTR_FINDER web服务器。给定DNA序列，它通过考虑常见结构特征准确预测全长LTR反转录转座子的位置和结构。LTR_FINDER是一个能够快速扫描大规模序列的系统，也是第一个用于从头算LTR反转录转座子发现的web服务器。我们说明了它在酿酒酵母基因组上的用途和性能。web服务器可在以下位置自由访问：http://tlife.fudan.edu.cn/ltr_finder/。 主页： http://tlife.fudan.edu.cn/ltr_finder/ 相关软件： 最大允许偏差;算法457;T-咖啡;卡林;肌肉;拉根;瓦伦;重新搜索;直径-TX;ClustalW公司;DIALIGN公司;Pfam公司;RegulonDB公司;爆炸2GO;PROSITE公司;KEGG公司;MetaCyc公司 引用于： 1文件 4位作者引用 1 玛丽亚·费德里科 1 皮埃尔·佩特隆戈 1 纳迪亚·皮桑蒂 1 法国玛丽·萨戈 连载1篇 1 离散应用数学 在2个字段中引用 1 计算机科学（68至XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文