发霉 swMATH ID: 1311 软件作者： K.Refson公司 描述： Moldy：用于串行和并行计算机的便携式分子动力学模拟程序。Moldy是一个高度可移植的C程序，用于使用周期性边界条件对固体和液体进行分子动力学模拟。它在传统工作站上或使用MPI或BSP等并行通信库接口的并行系统上以串行模式运行。“复制数据”并行化策略用于以最小的串行和并行代码差异实现合理的性能。该代码已针对串行和并行情况下的高性能进行了优化。模型系统完全在运行时输入文件中指定，可以包含任何混合物中的原子、分子或离子。在刚性分子近似下处理分子或分子离子，并使用四元数方法模拟其旋转运动。使用Beeman算法的修改形式对运动方程进行积分。可以在通常的NVE系综或等压和/或等温系综中进行模拟。支持Lennard-Jones、6-exp和MCY形式的势函数，代码结构简单，可提供添加新函数形式的接口。Ewald方法用于计算长期静电力。 主页： http://cpc.cs.qub.ac.uk/summaries/ADLT_v1_0.html 编程语言： C、。 操作系统： Unix、VAX/VMS、OpenVMS、DOS、Windows 95。 关键词： 分子动力学;凝聚态物质;模拟;平行;库仑（Coulombic）;固态物理学;其他。 相关软件： LPMD公司;DL_POLY_3型 引用于： 5文件 标准条款 1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份 Moldy：用于串行和并行计算机的便携式分子动力学模拟程序。 Zbl 1040.81501号基思·雷夫森 2000 全部的 前5名被9位作者引用 2 布莱恩·哈特霍恩（Bryan C.Hathorn）。 2 斯特凡·施拉普 1 塞尔吉奥·戴维斯。 1 Felipe A.González。 1 克劳迪娅·洛约拉 1 Joaquín Peralta 1 基思·雷夫森 1 Słowicka，Agnieszka M。 1 瓦伦塔，Z.A。 4篇连载文章中引用 2 计算机物理通信 1 计算物理杂志 1 冲击波 1 波兰科学院公报。技术科学 在4个字段中引用 三 流体力学（76-XX） 2 量子理论（81-XX） 2 统计力学，物质结构（82-XX） 1 可变形固体力学（74-XX） 按年份列出的引文