发霉 swMATH ID: 1311 软件作者: K.Refson公司 描述: Moldy:用于串行和并行计算机的便携式分子动力学模拟程序。Moldy是一个高度可移植的C程序,用于使用周期性边界条件对固体和液体进行分子动力学模拟。它在传统工作站上或使用MPI或BSP等并行通信库接口的并行系统上以串行模式运行。“复制数据”并行化策略用于以最小的串行和并行代码差异实现合理的性能。该代码已针对串行和并行情况下的高性能进行了优化。模型系统完全在运行时输入文件中指定,可以包含任何混合物中的原子、分子或离子。在刚性分子近似下处理分子或分子离子,并使用四元数方法模拟其旋转运动。使用Beeman算法的修改形式对运动方程进行积分。可以在通常的NVE系综或等压和/或等温系综中进行模拟。支持Lennard-Jones、6-exp和MCY形式的势函数,代码结构简单,可提供添加新函数形式的接口。Ewald方法用于计算长期静电力。 主页: http://cpc.cs.qub.ac.uk/summaries/ADLT_v1_0.html 编程语言: C、。 操作系统: Unix、VAX/VMS、OpenVMS、DOS、Windows 95。 关键词: 分子动力学;凝聚态物质;模拟;平行;库仑(Coulombic);固态物理学;其他。 相关软件: LPMD公司;DL_POLY_3型 引用于: 5文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 Moldy:用于串行和并行计算机的便携式分子动力学模拟程序。 Zbl 1040.81501号基思·雷夫森 2000 全部的 前5名被9位作者引用 2 布莱恩·哈特霍恩(Bryan C.Hathorn)。 2 斯特凡·施拉普 1 塞尔吉奥·戴维斯。 1 Felipe A.González。 1 克劳迪娅·洛约拉 1 Joaquín Peralta 1 基思·雷夫森 1 Słowicka,Agnieszka M。 1 瓦伦塔,Z.A。 4篇连载文章中引用 2 计算机物理通信 1 计算物理杂志 1 冲击波 1 波兰科学院公报。技术科学 在4个字段中引用 三 流体力学(76-XX) 2 量子理论(81-XX) 2 统计力学,物质结构(82-XX) 1 可变形固体力学(74-XX) 按年份列出的引文