ProDiGe公司 swMATH编号: 12407 软件作者: 芳汀·莫德莱特;垂直Jean-Philippe 描述: ProDiGe:通过多任务机器从阳性和未标记的示例中学习疾病基因的优先级。阐明人类疾病的遗传基础是遗传学和分子生物学的中心目标。虽然传统的连锁分析和现代高通量技术通常提供数十或数百个疾病候选基因的长列表,但在候选基因中识别疾病基因仍然耗时且昂贵。因此,需要有效的计算方法,通过利用各种数据库中有关基因的丰富信息,对候选列表中的基因进行优先级排序。结果:我们提出了一种新的疾病基因优先排序算法ProDiGe。ProDiGe实施了一种新的机器学习策略,该策略基于从阳性和未标记的示例中学习,允许集成有关基因的各种信息源,跨疾病共享有关已知疾病基因的信息,并执行新疾病基因的全基因组搜索。对真实数据的实验表明,ProDiGe在人类疾病基因优先排序方面优于最先进的方法。结论:ProDiGe实现了一种新的基因优先排序机器学习范式,可以帮助识别新的疾病基因。可在以下网址免费获取:http://cbio.ensmp.fr/prodige . 主页: http://cbio.ensmp.fr/~jvert/svn/prodige/html/ 相关软件: SMOTE公司;阿勒夫;PRMLT公司;梅德达;集成SVM;LIBLINEAR银行;伦敦银行支持向量机 引用于: 4文件 全部的 前5名13位作者引用 1 杰萨·贝克尔 1 马克·克莱森 1 杰西·戴维斯 1 Bart L.R.De Moor。 1 弗兰克·德·斯梅特 1 乔伊迪普·戈什 1 奥卢瓦桑米·科耶霍 1 Lee,Cheng先生 1 梁,叶 1 刘铁明 1 苗族、朱琦 1 约翰·苏肯斯(Johan A.K.Suykens)。 1 王汝 引用于3个系列 2 机器学习 1 机器学习研究杂志(JMLR) 1 应用统计学年鉴 在3个字段中引用 3 统计学(62-XX) 2 计算机科学(68至XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 按年份列出的引文