CFinder公司

定位生物网络中的集团和重叠模块。摘要:大多数细胞任务不是由单个蛋白质完成的,而是由一组功能相关的蛋白质(通常称为模块)来完成。在蛋白质关联网络中,网络模块表现为一组紧密相连的节点,也称为社区或集群。这些模块通常相互重叠,形成自己的网络,其中节点(链路)代表模块(重叠)。我们引入了CFinder,这是一个快速的程序,可以在无向图中定位和可视化重叠的、紧密连接的节点组,并允许用户轻松地在原始图形和这些组的网络之间导航。我们证明,在基因(蛋白质)关联网络中,CFinder可以用来预测单个蛋白质的功能和发现新的模块。CFinder也非常有效地定位大型稀疏图的团。可用性:CFinder(适用于Windows、Linux和Macintosh)及其手册可从http://angel.elte.hu/clustering下载。补充信息:补充数据可在线获取。联系人:cfinder@angel.elte.hu


zbMATH参考文献(19篇文章引用)

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