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半胱天冬氨酸

swMATH ID: 12242
软件作者: Kaderali,L。;Zander,T。;Faigle,美国。;Wolf,J。;舒尔茨,J.L。;R.施拉德。
描述: CASPAR:一种从基因表达数据预测癌症生存时间的分层贝叶斯方法。动机:DNA微阵列可以同时测量任何给定患者样本中的数千个基因表达水平。基因表达数据已被证明与几种癌症的生存率相关,然而,数据分析很困难,因为通常最多只有几百名患者可用,导致回归或分类模型严重不确定。有几种方法可以将患者分为不同的风险类别,然而,在实际生存时间的预测方面却做得相对较少。我们介绍了CASPAR,一种基于微阵列测量预测个体患者真实生存时间的新方法。CASPAR基于嵌入贝叶斯框架中的多元Cox回归模型。回归参数的分层先验分布专门设计用于处理高维(大量基因)和低样本量设置,这是微阵列测量的典型特征。这使得CASPAR能够自动选择信息量最大的小基因子集进行预测。
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/22/12/1495.short
相关软件: XPPAUT公司威尔科克斯CV风险评估基因模式GeneSrF公司姆博斯特R(右)
引用于: 5文件

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