贞洁

Chaste：将一个新的多尺度时空算法整合到一个大型开源库中。最近的工作描述了作为癌症、心脏和软组织环境（Chaste）项目的一部分而建立的软件工程和计算基础设施。Chaste是一个开源软件包，目前具有心脏和癌症建模功能。这个软件是用从商业领域引进的编程范例编写的，它的代码经过了比这个领域通常要严格得多的测试程序。在本文中，我们将解释如何将新功能整合到chate中。Whiteley开发了一种求解bidomain方程的数值算法，该算法利用生理学模型的多尺度特性来提高计算效率。使用一个二维的简单几何体和一个专门构建的代码，该算法被报道可以使计算效率提高两个数量级以上。在这篇文章中，我们首先回顾了目前用于求解bidomain方程的数值方法，解释了这些方法是如何发展为使用上面讨论的MS算法的。然后，我们演示了该算法在Chaste框架内用于求解三维真实心脏几何中的单域和双域方程。最后，我们将讨论如何开发贞洁来包含新的生理功能，例如模拟心脏跳动和心脏中的液体流动，以及如何结合旨在提高代码效率的新算法。