×

iDynoR公司

swMATH ID: 11206
软件作者： 基兰·奥尔登，Jan-Ulrich Kreft
描述： iDynoR:R iDyno MiCS仿真结果分析包。iDynoMiCS是一个由国际研究团队开发的计算机程序，其目的是以个性化的方式建模和模拟微生物群落。Lardon等人在2011年出版的《环境微生物学》（Environmental Microbiology）上发表的论文“iDynoMiCS：下一代基于个体的生物膜建模”中对此进行了详细描述。模拟以XML文件格式生成结果，描述每个时间步中每个物种的状态（agent_state）、一个时间点的物种统计信息摘要（agent_Sum）、每个时间步内每个溶质网格的状态（env_state。这个R包提供了一种将XML数据读入R的方法，以便可以对模拟响应进行统计分析。iDynoMiCS可从iDyno MiCS.org网站获得，该网站提供了有关使用模拟和此R包的完整教程。
主页： http://cran.r-project.org/web/packages/iDynoR/index.html
源代码：  https://github.com/cran/iDynoR
依赖项： R（右）
相关软件： 生物膜模拟；BacSim公司；Matlab公司；AQUASIM公司；MATLAB ODE套件；代码23；代码113；奥德15；代码45；代码23；蝙蝠侠；OpenTURNS公司；ElemStatLearn（电子状态学习）；AceFEM公司；COBRA工具箱；通信统计局；DFBA实验室；KEGG公司；斐济；达科塔
引用于： 11文件
全部的 前5名

38位作者引用

三 安娜·卡皮奥
2 路易吉·弗伦佐
2 拉斐尔·冈萨雷斯-阿尔巴雷乔
2 玛丽亚·罗萨里亚·马泰
1 D.阿皮约。
1 霍普·T·巴达维。
1 比约恩·比尼尔
1 马库斯·伯勒
1 安东尼奥·博利亚·阿尔贝罗
1 贾斯汀·布兰特纳。
1 埃琳娜·塞布里安
1 柯蒂斯·B·克莱蒙斯。
1 达库恩托，贝拉迪诺
1 亚历山大·埃利特（Alexander E.Ehret）。
1 乔瓦尼·埃斯波西托
1 金、星
1 凯文·克莱德。
1 拉蒂夫，Majid jun。
1 卢，C。
1 托拜厄斯·M·卢。
1 文森佐·隆戈
1 五月，Elebeoba E。
1 詹姆斯·K·米勒。
1 艾米·米尔斯特德
1 J.M.穆顿。
1 尤恩·佩乔德
1 弗朗西斯科·皮罗齐
1 M.C.罗乔。
1 桑普森，S.L。
1 梅萨姆·索莱马尼
1 安德烈亚·特鲁基亚
1 Vidal，完美
1 Patrick O。Wagers。
1 马修·沃戈。
1 帕特·威尔伯
1 杰拉尔德·W·杨。
1 Wiley J.Youngs。
1 Yun，Yang H。
全部的 前5名

8篇连载文章中引用

2 数学生物学通报
2 非线性科学与数值模拟中的通信
1 应用力学与工程中的计算机方法
1 数学生物学杂志
1 计算力学
1 数学医学与生物学
1 计算物理中的通信
1 理论生物学杂志
全部的 前5名

在6个字段中引用

9 生物学和其他自然科学（92-XX）
2 偏微分方程（35-XX）
2 可变形固体力学（74-XX）
2 流体力学（76-XX）
1 概率论与随机过程（60-XX）
1 数值分析（65-XX）

按年份列出的引文