奥古斯都

AUGUSTUS是一个在真核生物基因组序列中预测基因的程序。它可以在这个web服务器上运行,也可以在新的web服务器上运行以获得更大的输入文件,或者下载并在本地运行。它是开源的,所以你可以为你的计算平台编译它。你现在可以在德国的医疗网格上运行奥古斯都了。这使您能够提交更大的序列文件,并允许在预测中使用蛋白质同源性信息。MediGRID要求第一次使用的用户可以通过电子邮件即时轻松注册。


数学参考文献

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按年份排序(引用)

  1. Tillquist,Richard C.;Lladser,Manuel E.:基因组序列的低维表示(2019年)
  2. Carugo,Oliviero(编辑);Eisenhaber,Frank(编辑):生命科学的数据挖掘技术(2016)
  3. Axelson Fisk,Marina:比较基因发现。模型、算法和实现(2015)
  4. Brown,Daniel G.;Truszkowski,Jakub:使用标签上距离度量的隐马尔可夫模型的新解码算法(2010)ioport公司
  5. Keller,Oliver:基因组序列计算注释的概率方法(2010)
  6. Stanke,Mario;Keller,Oliver;Gunduz,Irfan;Hayes,Alec;Waack,Stephan;Morgenstern,Burkhard:AUGUSTUS:\textItabinito预测替代转录本。(2006年)ioport公司
  7. Mario Stanke;Morgenstern,Burkhard:AUGUSTUS:真核生物基因预测的web服务器,允许用户定义约束。(2005年)ioport公司
  8. 斯坦克,马里奥;斯坦坎普,拉斯穆斯;瓦克,斯蒂芬;摩根斯特恩,伯克哈德:奥古斯都:一个在真核生物中寻找基因的网络服务器。(2004年)ioport公司
  9. 斯坦克,马里奥:用隐马尔可夫模型进行基因预测。(2003年)


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