PhyML(物理建模语言) swMATH ID: 10915 软件作者: Guindon S.、Dufayard J.F.、Lefort V.、Anisimova M.、Hordijk W.、Gascuel O。 描述: PhyML是一种通过核苷酸或氨基酸序列的比对来估计最大似然系统发育的软件。它提供了广泛的选项,旨在促进标准的系统发育分析。PhyML的主要优势在于大量的替代模型与各种选项相结合,以搜索系统发育树拓扑空间,从非常快速有效的方法发展到速度较慢但通常更准确的方法。它还实现了两种方法来评估可靠统计框架中的分支支持(非参数bootstrap和近似似然比测试)。(http://packages.ubuntu.com/lucid/science/phyml) 主页: http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/binaries.php 相关软件: 贝叶斯先生;RAxML公司;野兽;PAUP公司*;MAFFT公司;github;MEGA公司;猿;菲律宾;fastDNAml(快速DNAml);SVD四重奏;Clustal X公司;treeOclock树;SPR超级树;rSPR;ElemStatLearn(电子状态学习);引导数据库;多晶硅;SigClust公司;pvclust(群集) 引用于: 12文件 全部的 前5名29位作者引用 1 马格努斯伯德威奇 1 莉娜·科利恩 1 洛林·克劳福德 1 加布里埃拉·贝特拉(Gabriela Bettella Cybis) 1 安德鲁·弗朗西斯。 1 加夫柳什金,亚历克斯 1 彼得·贾维斯。 1 姜玉山 1 萨拉·卡利什尼克·维罗夫舍克 1 乔纳森·克拉维特 1 西蒙·林茨 1 西尔维亚共和国洛佩斯。 1 托马斯·路德维希 1 哈拉尔德·迈耶 1 莫诺德、安提亚 1 帕蒂尼奥·加林多,胡安·安格尔 1 埃内斯托·皮卡迪 1 卡拉·夸利亚列洛 1 查尔斯·森普尔 1 亚历山大·斯塔马塔基斯(Alexandros P.Stamatakis)。 1 斯蒂尔,迈克尔·安东尼 1 杰里米·萨姆纳。 1 爱德华·苏斯科 1 马尔西奥·瓦尔克 1 王晓敏 1 Tandy J.沃诺。 1 张东凯 1 朱,沙 1 朱文燕 全部的 前5名10篇连载文章中引用 1 加拿大统计杂志 1 数学生物学杂志 1 数学生物科学 1 统计计算与模拟杂志 1 离散数学和理论计算机科学。DMTCS公司 1 计算生物学和化学 1 物理学报A:数学与理论 1 计算生物学 1 理论生物学杂志 1 SIAM应用代数和几何杂志 全部的 前5名在9个字段中引用 9 生物学和其他自然科学(92-XX) 4 统计学(62-XX) 2 组合数学(05-XX) 2 计算机科学(68至XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 代数几何(14-XX) 1 代数拓扑(55-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 运筹学、数学编程(90-XX) 按年份列出的引文