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PhyML(物理建模语言)

swMATH ID: 10915
软件作者: Guindon S.、Dufayard J.F.、Lefort V.、Anisimova M.、Hordijk W.、Gascuel O。
描述: PhyML是一种通过核苷酸或氨基酸序列的比对来估计最大似然系统发育的软件。它提供了广泛的选项,旨在促进标准的系统发育分析。PhyML的主要优势在于大量的替代模型与各种选项相结合,以搜索系统发育树拓扑空间,从非常快速有效的方法发展到速度较慢但通常更准确的方法。它还实现了两种方法来评估可靠统计框架中的分支支持(非参数bootstrap和近似似然比测试)。(http://packages.ubuntu.com/lucid/science/phyml)
主页: http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/binaries.php
相关软件: 贝叶斯先生;RAxML公司;野兽;PAUP公司*;MAFFT公司;github;MEGA公司;;菲律宾;fastDNAml(快速DNAml);SVD四重奏;Clustal X公司;treeOclock树;SPR超级树;rSPR;ElemStatLearn(电子状态学习);引导数据库;多晶硅;SigClust公司;pvclust(群集)
引用于: 12文件

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