PSICO公司 swMATH编号: 10910 软件作者: 路德维希·克里帕尔;佩德罗·巴拉奥纳 描述: PSICO:用约束编程和优化求解蛋白质结构。本文提出PSICO(Processing Structural Information with Constraint programming and Optimisation)作为一种基于约束的方法,用于确定与从核磁共振(NMR)数据获得的距离约束相容的蛋白质结构。我们将我们提出的算法与基于模拟退火的现有商业应用程序DYANA(“NMR应用程序的动态算法”)的性能进行了比较。在含有二聚体蛋白脱硫多辛实验数据的测试案例中,与DYANA大约10小时的计算时间相比,本文提出的方法在不到10分钟的时间内提供了类似的结果。虽然结果的质量仍然可以提高,但这表明CP技术可以大大减少计算时间,这是一个主要优点,因为结构核磁共振技术通常需要多次结构计算。 主页: http://link.springer.com/article/10.1023%2FA%3A102057763762 关键词: 约束编程;优化;蛋白质结构;生物信息学 相关软件: 椰子;全球实验室;BARON公司;国际实验室;国际博协;InC公司++;JGlopt实验室;并入PT_90;UniCalc公司;卢鲁帕;牛顿;数字;COPRIN公司;RealPaver公司;GLOPT公司;更大的 引用于: 9文件 全部的 前5名15位作者引用 三 佩德罗·巴拉奥纳 三 穹顶,费伦茨 2 路德维希·克里帕尔 2 阿诺德·诺伊梅尔 1 马可·科雷亚 1 哈尼族El Sakkout 1 奥利·卡马拉宁 1 Kapsokalivas,L。 1 艾丽特·凯特里尔 1 凯文·科弗勒 1 蒂亚戈·蒙塔赫 1 赫尔曼·施奇尔 1 凯瑟琳·斯坦尼费尔(Kathleen K.Steinhöfel)。 1 斯文·泰尔 1 A.Dayem乌拉 4篇连载文章中引用 2 约束条件 1 比特币 1 人工智能通信 1 全球优化杂志 在4个字段中引用 6 计算机科学(68至XX) 三 运筹学、数学规划(90-XX) 2 数值分析(65-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文