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原分子

swMATH ID: 10728
软件作者: Matthey,Thierry;特雷弗·奇科夫斯基;斯科特·汉普顿;Ko,Alice;马群;马修·尼尔吉斯(Matthew Nyerges);特洛伊州雷德;托马斯·斯拉巴赫;耶苏斯·A·伊扎古尔。
描述: ProtoMol是一个面向对象的框架,用于为分子动力学的新算法制作原型。ProtoMol是C++中的一个高性能框架,用于快速原型化分子动力学和相关应用的新算法。它的灵活性主要是通过使用继承和设计模式(面向对象编程)来实现的。通过使用能够为对性能至关重要的部分生成高效代码的模板(通用编程),可以获得性能。该框架封装了开发人员可以使用的重要优化,例如力计算中的并行性。其设计基于分子动力学(MD)数值积分器和力计算快速求解器的域分析,特别是由于静电相互作用。ProtoMol中实现了几种新的高效算法。最后,与领先的MD程序相比,ProtoMol的顺序性能非常好,并且它可以很好地扩展到中等数量的处理器。Windows、Linux、Solaris、IRIX、HP-UX和AIX平台的二进制文件和源代码可在以下位置获得开源许可http://protomol.sourceforge.net。
主页: http://protomol.sourceforge.net
相关软件: OOMPAA公司;GSHMC公司;磁粉探伤;;线性代数库;LAPACK公司;闪电战++;SPASMS系统;设置;名称2;格鲁马克斯
引用于: 8文件

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