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URDME公司

swMATH ID:	10400
软件作者：	Drawert，B.，Engblom，S.，Hellander，A。
描述：	Urdme：一个模块化框架，用于复杂几何体中反应迁移过程的随机模拟。我们开发了URDME，这是一个用于一般随机反应迁移建模和模拟的灵活软件框架。URDME使用非结构化三角形和四面体网格来解析一般几何图形，并依赖于反应扩散主方程形式来建模所研究的过程。成熟的几何和网格处理外部软件（Comsol Multiphysics）的接口为模型构建提供了稳定的交互式环境。核心仿真例程从逻辑上与模型构建接口分离，并用低级语言编写，以提高计算效率。通过Matlab接口实现与几何处理软件的连接，该接口有助于脚本计算、数据管理和后处理。因此，对于实践者来说，该软件的行为就像一个交互式Matlab工具箱。同时，可以使用新开发的仿真程序修改和扩展URDME。由于总体设计有效地隐藏了管理几何体和网格的复杂性，这意味着新开发的方法可以在开发早期的实际环境中进行测试。
主页：	http://sourceforge.net/projects/urdme（网址：http://sourceforge.net/projects/urdme）/
相关软件：	MesoRD公司;台阶;斯莫尔丁;里迪;瓦沃斯;PySB公司;斯托奇SS;特拉维斯CI;皮斯托斯帕;蟒蛇;pybind11;斯托斯帕2;物理细胞;SimInf公司;R（右）;EpiModel公司;GillespieSSA公司;阿米伊;天然气液化;起重机
引用于：	25文件

8	Lötstedt，Per公司
6	斯特凡·恩格布洛姆
6	安德烈亚斯·海兰德
三	牧师Mark A.J。
三	毛里西奥·德尔·拉佐。
三	莉娜·梅内克
2	拉德克·埃尔班
2	斯特凡·海兰德
2	费利克斯·Höfling
2	塞缪尔·艾萨克森。
2	西塞利·K·麦克纳马拉。
2	伊莱恩·米切尔一世。
2	琳达·鲁思·佩佐德
2	史蒂芬妮·温克尔曼
1	Agbanusi、Ikemefuna Chukwuemeka
1	阿尔达赫勒，萨哈尔
1	艾米莉·布朗
1	奥古斯丁·谢瓦利埃
1	马西耶·齐沃斯基
1	布莱恩·德莱特
1	约翰·埃尔夫
1	弗姆，拉尔斯
1	马克·B·弗莱格。
1	丹妮拉·弗伦伯格
1	拉蒙·格里玛
1	蒋崇明
1	鲁珀特·克莱因
1	克洛萨，简
1	迈克尔·劳森。
1	谢夫·麦克纳马拉。
1	汉斯·奥瑟默（Hans G.Othmer）。
1	钱，洪
1	克里斯托夫·施尤特
1	邵元志
1	亚瑟五世斯特劳贝。
1	马克·斯特罗克
1	Zuzanna，Szymaánska
1	王思阳
1	杨仁龙
1	张颖