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EDAseq公司

swMATH ID: 10345
软件作者: 大卫·里索;桑德琳·杜多瓦
描述: EDASeq:探索性数据分析和RNA-Seq标准化。RNA-Seq读取数据的数字和图形摘要。使用车道归一化程序调整读取计数的GC含量效应(或其他基因级效应):黄土稳健局部回归、全局尺度和全分位数归一化(Risso等人,2011年)。用于调整车道之间分布差异(例如,测序深度)的车道间归一化程序:全局缩放和全分位数归一化(Bullard等人,2010年)。
主页: http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/EDASeq.html
依赖项: R(右)
相关软件: DEseq公司BaySeq公司边缘R生物导体R(右)双集群扩展器BiGGEsTS系列块簇BicAT公司UCI-毫升Hadoop公司MPI公司cghseg公司SRA公司变点起重机DEGseq公司RUVseq公司阿菲
引用于: 5文件

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