EDAseq公司 swMATH ID: 10345 软件作者: 大卫·里索;桑德琳·杜多瓦 描述: EDASeq:探索性数据分析和RNA-Seq标准化。RNA-Seq读取数据的数字和图形摘要。使用车道归一化程序调整读取计数的GC含量效应(或其他基因级效应):黄土稳健局部回归、全局尺度和全分位数归一化(Risso等人,2011年)。用于调整车道之间分布差异(例如,测序深度)的车道间归一化程序:全局缩放和全分位数归一化(Bullard等人,2010年)。 主页: http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/EDASeq.html 依赖项: R(右) 相关软件: DEseq公司;BaySeq公司;边缘R;生物导体;R(右);双集群;扩展器;BiGGEsTS系列;块簇;BicAT公司;UCI-毫升;Hadoop公司;MPI公司;cghseg公司;SRA公司;变点;起重机;DEGseq公司;RUVseq公司;阿菲 引用于: 5文件 全部的 前5名52位作者引用 2 艾丽斯·克莱恩 2 桑德琳·杜多特 2 罗宾(Stéphane Robin) 1 马可·阿尔夫 1 杰米·阿尔纳西尔。 1 彼得·约翰·比克尔 1 内森·博利 1 詹姆斯·本特利·布朗 1 陈梦洁 1 陈云顺 1 钟东军 1 莱昂纳多·科拉多·托雷斯 1 索姆纳特·达塔 1 苏西米塔·达塔 1 杜若菲 1 方志德 1 艾莉莎·弗雷泽(Alyssa C.Frazee)。 1 德巴希·戈什 1 瑞安·吉尔。 1 桑托什·吉里拉扬 1 胡一娟 1 黄海燕 1 安德鲁·杰菲(Andrew E.Jaffe)。 1 Sunduz Keles公司 1 本·兰米德 1 Jeffrey T·利克。 1 李洪哲 1 刘鹏 1 道格拉斯·洛伦茨。 1 艾伦·T·L·伦。 1 弗朗西丝卡·马特拉 1 瑞登德拉纳特·米特拉 1 丹·奈特尔顿 1 恩盖,约翰 1 阿什利·彼得森 1 安德烈·里伯勒 1 戴维·里索 1 马克·罗宾逊。 1 朱莉娅·萨尔兹曼 1 Seshan,Venkatraman E。 1 Hugh P.Shanahan。 1 司亚青 1 戈登·史密斯(Gordon K。Smyth)。 1 特伦斯·保罗,速度 1 孙伟 1 Tan、Kean Ming 1 丹妮拉·维滕(Daniela M.Witten)。 1 熊浩 1 张奎 1 张琪 1 赵宏宇 1 智、德贵 5篇连载文章中引用 1 国际计算机科学基础杂志 1 统计计算与模拟杂志 1 农业、生物和环境统计杂志 1 统计与计算 1 概率与统计科学的前沿 在2个字段中引用 4 统计学(62-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文