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SAHA-工具

swMATH ID: 10315
软件作者: 达里奥·坎帕尼亚;卡拉广场
描述: 混合自动机、可达性和系统生物学。混合自动机是一种强大的形式主义,用于表示根据离散和连续定律演化的系统。不幸的是,当人们试图自动验证混合自动机属性时,很快就会出现不可判定性。一个重要的验证问题是可达性问题,它要求决定一组点是否从起始区域可达。par如果我们关注半代数混合自动机,可达性问题是半可判定的。然而,要解决这个问题必须付出高昂的计算成本。我们利用现有的一些工具分析了这个问题,并表明即使是简单的例子也无法有效地解决。有必要引入近似值来减少变量的数量,因为这是运行时需求的主要来源。我们提出了一些基于泰勒多项式和特殊策略的标准逼近方法。我们在SAHA-Tool软件中实现了我们的方法,并在两个生物学示例上显示了它们的有效性:阻遏因子和Delta-Notch蛋白信号。
主页: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304397509008512
关键词: 半代数自动机可达性系统生物学
相关软件: OCaml公司日/日H溶剂Uppaal公司RSOLVER公司高超声速克洛诺斯QEPCAD公司
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1 计算机科学(68至XX)

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