波形规格0 swMATH ID: 8760 软件作者: 陈硕;Don Hong;于希尔 描述: 基于小波的蛋白质组质谱数据处理程序。蛋白质组学旨在确定蛋白质的结构、功能和表达。高通量质谱(MS)是蛋白质组学革命中的领先技术。尽管它可以用于从容易获得的样品中提取的蛋白质混合物中发现与疾病相关的蛋白质模式,但蛋白质组质谱数据的处理仍然存在关键挑战。小波等多尺度数学工具在信号处理和统计数据分析中发挥着重要作用。提出了一种基于小波的蛋白质组数据处理算法。本文介绍了该软件包WaveSpect0的MATLAB实现,包括步长统一、自适应平稳离散小波去噪、使用样条曲线进行基线校正、归一化、峰值检测以及使用聚类技术设计的新峰值对齐方法的处理过程。在范德比尔特-英格拉姆癌症中心不同癌症研究项目的真实MS数据集中的应用表明,该算法在MS数据挖掘中是有效且令人满意的。 主页: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167947307000576 关键词: 蛋白质组数据处理;生物标志物发现;质谱法;样条曲线;小波 相关软件: ElemStatLearn(电子状态学习);R(右);Matlab公司;SABoost公司;鲁棒基地;线索 引用于: 4文件 全部的 前5名12位作者引用 1 陈硕 1 克利斯朵夫·克鲁斯 1 埃夫斯特拉蒂奥斯·加洛普洛斯 1 唐·洪 1 西尔万·莱曼 1 尼古拉斯·莫利纳里 1 多米尼克牧师 1 克里斯托尔·雷内斯 1 罗伯特·萨巴蒂尔 1 于希尔 1 范·艾尔斯特·斯特凡 1 查、宏远 在1个序列中引用 4 计算统计与数据分析 全部的 前5名在6个字段中引用 4 统计学(62-XX) 2 计算机科学(68至XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 信息与通信理论、电路(94-XX) 按年份列出的引文