乌西加奇 swMATH ID: 32598 软件作者： 谢福斋、乔安娜·加伊达、泰勒·F.W.·斯隆、安德烈·雷尔斯、杰森·汀·春秋、艾米·秦·沈 描述： Usiigaci：通过机器学习实现的无染色相差显微镜中的实例感知细胞跟踪。无染色、单细胞分割和追踪无异于显微镜下细胞迁移分析的圣杯。众所周知，高密度细胞的相位对比显微镜（PCM）图像很难准确分割；因此，手动分割仍然是事实上的标准做法。在这项工作中，我们引入了Usiigaci，这是一种一体式的半自动化管道，用于分割、跟踪和可视化PCM中的细胞运动和形态变化。使用掩码区域卷积神经网络（mask R-CNN）实现无污渍实例软件分割。开发了一种基于Trackpy的具有图形用户界面的细胞跟踪器，用于细胞跟踪和数据验证。通过NIH/3T3成纤维细胞的趋电性验证Usiigaci的性能。Usiigaci为定量细胞迁移分析提供了高度准确的细胞运动和形态学信息。 主页： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352711018301882 源代码： https://github.com/oist/Usiigaci网站 关键词： 相差显微镜；实例软件分割；机器学习；卷积神经网络；无染色细胞追踪；单细胞迁移；软件X 相关软件： PyQt公司；Seaborn公司；马特普洛特利布；scikit-图像；FogBank银行；CUDA公司；科学Py；熊猫；Trackpy公司；PyQtGraph（PyQt图表）；蟒蛇；凯拉斯；TensorFlow公司；MS-COCO公司 引用于： 0个文档 标准条款 1出版物描述软件 年份 Usiigaci：通过机器学习实现无染色相差显微镜中的实例软件细胞跟踪链接谢福斋、乔安娜·加伊达、泰勒·F.W.·斯隆、安德烈·雷尔斯、杰森·汀·春秋、艾米·秦·沈 2019