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图形变量

swMATH ID: 26482
软件作者: Lea Waller;阿纳斯塔西娅·布罗夫金;Lena Dorfschmidt;Danilo Bzdok;亨利克·沃尔特;约翰·丹尼尔·克鲁斯威茨
描述: GraphVar 2.0:一个用户友好的工具箱,用于功能连接度量的机器学习。我们之前将GraphVar作为一个用户友好的MATLAB工具箱,用于大脑功能连接的综合图形分析。在这里,我们介绍了工具箱的全面扩展,允许用户无缝地探索跨功能连接度量以及其他功能的轻松自定义解码模型。新方法:GraphVar 2.0提供机器学习(ML)模型构建、验证和探索。机器学习可以跨网络测量和其他变量的任何组合进行,从而在神经成像应用中实现灵活性。结果:除了以前集成的功能外,例如网络构建和使用高速通用线性模型(GLM)对大脑连接进行的图形理论分析,用户现在可以跨连接矩阵、网络度量和额外导入的变量执行可定制的ML。新的扩展还提供了分类器和回归器性能的参数和非参数测试、数据导出、图形生成和高质量导出。与现有方法的比较:与其他现有工具箱相比,GraphVar 2.0提供了(1)全面的定制,(2)一体式用户友好界面,(3)可定制的模型设计和手动超参数输入,(4)交互式结果探索和数据导出,(5)自动提示,用于在同一会话中建模多个结果变量,(6)简单易懂的介绍性综述。结论:GraphVar 2.0允许对功能连接性度量的编码(GLM)和解码(ML)建模方法进行全面、用户友好的探索,使大数据神经科学容易为更广泛的神经影像研究人员所用。
主页: https://arxiv.org/abs/1803.00082
关键词: arXiv_发布;arXiv_状态.AP;MATLAB软件;图形用户界面;工具箱;功能连接;图论;机器学习;解码;编码;再现性;线性SV;弹性网;模型性能;嵌套交叉验证;计算神经科学;精密精神病学
相关软件: BrainNet查看器;电子连接时间;Matlab公司;经颅磁刺激脑电图;连接体映射器;CARTOOL公司;格菲;头脑风暴;现场跳闸;艾格拉布;EEG信号;大脑连接工具箱;BRAPH公司;巴斯科;GTG公司;连接器;GRETNA公司;动态BC;BSMART公司
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标准条款

1出版物描述软件 年份
GraphVar 2.0:一个用户友好的工具箱,用于功能连接度量的机器学习arXiv公司
Lea Waller;阿纳斯塔西娅·布罗夫金;Lena Dorfschmidt;Danilo Bzdok;亨利克·沃尔特;约翰·丹尼尔·克鲁斯威茨
2018