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AMoRe公司

swMATH ID: 22911
软件作者: Navaza J、Saludjian P。
描述: AMoRe:自动分子替换程序包。本章讨论自动分子替换(AMoRe)程序包。分子替换的基本问题是确定晶体细胞内分子的位置。这是通过将分子模型放置在暂定位置生成模型晶体结构,然后选择在计算的结构因子和观察的结构因子之间具有可接受的一致性的配置来实现的。这是朝着解决晶体结构的方向迈出的一步,随后将进行模型构建和细化程序。分子替换和对求解结构的后验分析导致优化了定义旋转和平移函数的不同参数,以提高旋转函数(RF)和平移函数(TF)峰值的信噪比。最初设计用于处理难题的软件包的成功是其主要特征的综合作用的结果:(1)通过快速算法探索由修正或新函数确定的许多潜在解决方案,(2)相关系数被用作主要选择标准,(3)来自已定位模型的信息被自动合并到过程中,并且(4)自动化程度很高。本章描述了软件包中使用的位置变量,并讨论了AMoRe的策略和结果。
主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0076687997760798
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