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CDAO商店

swMATH ID: 6415
软件作者: Brandon Chisham;恩里科·蓬泰利(Enrico Pontelli);儿子Tran Cao;本·赖特
描述: CDAOstore:使用逻辑编程和web服务的系统发育库CDAOStore是一个门户网站,旨在促进与进化生物学和系统发育分析领域研究相关的数据和元数据的存储和检索。CDAOStore的新颖之处在于使用基于语义的方法来存储和查询数据。这使得CDAOStore能够克服其他存储库(例如TreeBase)的数据格式限制和复杂性,并提供特定于域的查询接口,该接口源自对系统发育数据库查询需求的研究。par CDAOStore代表了EvoIO堆栈的第一个完整实现,由正式本体(比较数据分析本体)、XML交换格式(NeXML)和web服务API(PhyloWS)组成的互操作堆栈。CDAOStore是在RDF三重存储之上实现的,使用了标准web技术和逻辑编程技术的组合。特别是,我们使用Prolog来支持一些格式转换任务,更重要的是,在实现一些特定于域的查询时,这些查询的结构超出了标准RDF查询语言(例如SPARQL)的能力。CDAOStore正在运行,它已经托管了9000多万个RDF三元组,从TreeBase导入或由其他领域科学家提交。
主页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3101187/
关键词: 生物信息学;系统发育分析;序言;本体
相关软件: 普雷格尔;对夹2;Hadoop公司;阿司匹林;LPaaS公司;GHC公司;帕洛;四月;Yedalog公司;HaLoop公司;大数据日志;阳光;自动对开;斯莫德尔斯;伯克明州;萨特齐拉;达斯瓦姆;Multilisp公司;PhyloWS公司;GASP公司
引用于: 4文件

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