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犯罪现场调查

swMATH ID: 13904
软件作者: 克里斯托弗·彭福尔德(Christopher A.Penfold)。;艾哈迈德·希法兹;保罗·E·布朗(Paul E.Brown)。;Ann Nicholson;Wild,David L。
描述: CSI:一种非参数贝叶斯方法,用于从多扰动时间序列基因表达数据进行网络推断。在这里,我们介绍了因果结构识别(CSI)包,这是一种基于高斯过程的方法,用于从多个时间序列数据推断基因调控网络(GRN)。标准CSI方法通过多个时间序列数据集的联合学习推断出单个GRN;层次化方法(HCSI)为每个数据集推断出一个单独的GRN,尽管网络限制为支持类似结构,允许识别特定于上下文的网络。该软件在MATLAB中实现,并包括一个用于用户友好推理的图形用户界面(GUI)。最后,GUI可以连接到高性能计算机集群,以便于分析大型基因组数据集。
主页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26030796
依赖项: Matlab公司
关键词: 贝叶斯主义者;高斯过程;基因调控网络
相关软件: XnView(XnView);Sante DICOM查看器;梦想4;Matlab公司
引用于: 1文件

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