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BIVAS公司

swMATH ID: 43404
软件作者: 蔡明轩;戴明伟;明静思;彭,恒;刘,金;杨,肯
描述: BIVAS:一种可扩展的贝叶斯方法,用于应用程序的双层变量选择。在本文中,我们考虑了高维回归中的贝叶斯双层变量选择问题。在许多实际情况下,为每个预测值分配组成员是很自然的。例如,遗传变异可以在基因水平上分组,来自不同任务的协变量自然形成一个组。因此,从这些群体中选择重要群体以及重要成员是很有意义的。现有的马尔可夫链蒙特卡罗方法通常计算量很大,无法扩展到大型数据集。为了解决这个问题,我们考虑了双层变量选择的变分推理。与常用的平均场近似相比,我们提出了一种分层因式分解,通过使用双层变量选择结构来近似后验分布。此外,基于这种变分近似,我们开发了一种计算效率高且完全可并行的算法。我们进一步扩展了所开发的方法,以从多任务学习中建模数据集。仿真研究和实际数据分析的综合数值结果表明,与现有方法相比,BIVAS在变量选择、参数估计和计算效率方面具有优势。该方法在R包“bivas”中实现,可在https://github.com/mxcai/bivas网站(在新选项卡中打开)。本文的补充材料可在网上获得。
主页: https://arxiv.org/abs/1803.10439
源代码:  https://github.com/mxcai/bivas
依赖项: R(右)
相关软件: PRMLT公司高级网络格林特网BVSNLP公司EMVS公司国际货币数据库qqman(质量管理人员)GCTA公司ANNOVAR公司文字云PLINK公司ggplot2R(右)
引用于: 3文件

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统计学(62-XX)

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