TRANSFAC公司 34份文件引用(2001–2020) 软件作者： E.Wingender、X.Chen、R.Hehl、H.Karas、I.Liebich、V.Matys、T.Meinhardt、M.Prüß、I.Reuter、F.Schacherer 相关软件： JASPAR；KEGG；BioProspector… 主要字段： 组合数学（05-XX）；概率论与随机过程（60-XX）；统计学（62-XX）…
RegulonDB公司 在30份文件中引用(2002–2020) 软件作者： Gama-Castro，S。；Jimenez-Jacinto，V。；佩拉塔·吉尔，M。；桑托斯·扎瓦莱塔，A。；佩尼亚洛扎·斯皮诺拉，M.I。；孔特雷拉斯·莫雷拉，B。；Segura-Salazar，J。；Muñiz-Rascado，L。；马丁内斯·弗洛雷斯，I。；萨尔加多，H。；Bonavides-Martinez，C。；Abreu Goodger，C。；罗德里格斯-佩纳戈斯，C。；Miranda-Ríos，J。；Morett，E。；梅里诺，E。；韦尔塔，A.M。；Treviño-Quintanilla，L。；科拉多·维德斯，J。 相关软件： KEGG；阿拉伯国家石油公司；GeneNetWeaver… 主要字段： 组合数学（05-XX）；统计学（62-XX）；计算机科学（68-XX）…
JASPAR公司 23篇文献引用(2006–2021) 软件作者： 阿尔宾·桑德林（Albin Sandelin）、维南德·阿尔凯马（Wynand Alkema）、帕尔·恩格斯特罗姆（Pär Engström）、怀斯·W·瓦瑟曼（Wyeth W.Wasserman）、鲍里斯·伦哈德（Boris Lenhard） 相关软件： TRANSFAC公司；KEGG；BioProspector… 主要字段： 组合数学（05-XX）；统计学（62-XX）；计算机科学（68-XX）…
iNR-PhysChem公司 8份文件引用(2012–2018) 软件作者： Xiao X、Wang P、Chou KC 相关软件： 细胞定位；iSNO心理交流；iNuc-PhysChem… 主要字段： 组合数学（05-XX）；统计学（62-XX）；计算机科学（68-XX）…
生物优化器 4份文件引用(2006–2014) 软件作者： S.T.Jensen、J.S.Liu 相关软件： 游戏；印章；传输… 主要字段： 一般性和全局性主题；藏品（00-XX）；概率论与随机过程（60-XX）；统计学（62-XX）…
印章 2份文件引用（2014年至2020年） 软件作者： – 相关软件： 生物优化器；游戏；传输… 主要字段： 一般性和全局性主题；藏品（00-XX）；计算机科学（68-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
Cis模块 4份文件引用(2006–2015) 软件作者： 周，Q。；王伟华 相关软件： BioProspector；MCFDR；传输… 主要字段： 统计学（62-XX）；数值分析（65-XX）；统计力学，物质结构（82-XX）…
风景 5份文件引用(2019–2023) 软件作者： Aibar S、González-Blas CB、Moerman T、Huynh-Thu VA、Imrichova H、Hulselmans G、Rambow F、Marine JC、Geurts P、Aerts J、van den Oord J、Atak ZK、Wouters J、Aerts-S 相关软件： 玻璃；范围；ZIFA… 主要字段： 统计学（62-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
工厂TFDB 2份文件引用(2016–2019) 软件作者： Jin J、Tian F、Yang DC、Meng YQ、Kong L、Luo J、Gao G 相关软件： R；sva；KLU… 主要字段： 统计学（62-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
网络MOTIFS 2份文件引用(2013) 软件作者： 凯瑟琳·罗默（Katherine A.Romer）、盖·里查德·卡翁比亚（Guy-Richard Kayombya）、欧内斯特·弗伦克尔（Ernest Fraenkel） 相关软件： PhyME；WordSpy；MotifMiner… 主要字段： 计算机科学（68-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
DWE公司 3份文件引用（2007-2012） 软件作者： Sumazin P、Chen G、Hata N、Smith AD、Zhang T和Zhang MQ 相关软件： WebLogo；ClustalW；BioProspector… 主要字段： 一般性和全局性主题；藏品（00-XX）；概率论与随机过程（60-XX）；统计学（62-XX）…
HPAM公司 3份文件引用(2005–2011) 软件作者： 科蒂克，V。；Romero Zaliz，R。；I·兹维尔。 相关软件： RegulonDB；BacPP；信号群邮件… 主要字段： 计算机科学（68-XX）；运筹学、数学规划（90-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
PICS公司 3份文件引用(2011–2015) 软件作者： 张学奎；戈登·罗伯逊（Gordon Robertson）；Krzywinski，Martin；宁、凯达；阿诺德·德罗伊特；史蒂文·琼斯；拉斐尔·戈塔多 相关软件： FindPeaks；生物导体；R、 … 主要字段： 统计学（62-XX）；数值分析（65-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
减少 1份文件引用(2013) 软件作者： Wu，R。；Chaivorapol，C。；郑洁。；李，H。；Liang，S。 相关软件： WordSpy；MotifMiner；WebMOTIFS… 主要字段： 生物学和其他自然科学（92-XX）
TAD宾德先生 2份文件引用(2019–2021) 软件作者： Yan，K.-K.，Lou，S.，Gerstein，M。 相关软件： 修拉；全球麻省理工学院；桅杆… 主要字段： 统计学（62-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
NucPosPred（数字位置预测） 2份文件引用(2018–2019) 软件作者： 贾苍志；杨青；邹全（音） 相关软件： pSumo-CD；Prnam-PC；2L-piRNA… 主要字段： 计算机科学（68-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
奥雷加诺 1份文件引用(2016) 软件作者： Obi L.Griffith、Stephen B.Montgomery、Bridget Bernier等。 相关软件： UniPROBE；InteroPORC；JASPAR… 主要字段： 计算机科学（68-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
石油价格 2份文件引用（2018年至2021年） 软件作者： Zhang，Y。；林，Y.-H。；Johnson，T.D.Rozek；医学硕士Sartor。 相关软件： DESeq2；国际存托凭证；甲基试剂盒… 主要字段： 统计学（62-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
菲洛吉布斯 2份文件引用(2006–2011) 软件作者： Siddhartan，R.、van Nimwegen，E.、Siggia，E.D 相关软件： 模因；跟踪器2；T-咖啡… 主要字段： 计算机科学（68-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
DREM公司 1份文件引用(2019) 软件作者： Schulz MH、Devanny WE、Gitter A、Zhong S、Ernst J、Bar-Joseph Z 相关软件： sva；KLU；FATODE… 主要字段： 生物学和其他自然科学（92-XX）
MAnorm公司 1份文件引用(2021) 软件作者： Zhen Shao、Yijing Zhang、Guo-Cheng Yuan、Stuart H Orkin、David J Waxman 相关软件： 甲基试剂盒；勒博蒂；TFBS工具… 主要字段： 统计学（62-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
MotifCM公司 1份文件引用(2010) 软件作者： 刘丽芳；焦立成 相关软件： JASPAR；TRANSFAC公司；BioProspector公司 主要字段： 组合数学（05-XX）；统计学（62-XX）；计算机科学（68-XX）…
星云 1份文件引用(2016) 软件作者： 瓦伦蒂娜·博埃娃（Valentina Boeva）、阿尔本·勒敏（Alban Lermine）、卡米尔·巴雷特（Camille Barette）、克里斯特尔·吉洛夫（Christel Guillouf）、艾曼纽尔·巴里略（Emmanuel Barillot） 相关软件： 其mr；快速质量控制；ODoSE… 主要字段： 概率论与随机过程（60-XX）；统计学（62-XX）
ODIN公司 1份文件引用(2021) 软件作者： 曼纽尔·奥尔霍夫（Manuel Allhoff）、海克·乔维斯特（Heike Chauvistré）、克里斯汀·塞雷（Kristin Seré 相关软件： 甲基试剂盒；勒博蒂；TFBSTools… 主要字段： 统计学（62-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
psRNA目标 1份文件引用(2019) 软件作者： 戴新斌；赵学春（Patrick Xuechun Zhao） 相关软件： 塔皮尔；LncmiRSRN基因 主要字段： 生物学和其他自然科学（92-XX）
scE路径 1份文件引用(2022) 软件作者： Jin，S。；麦克莱恩，A.L。；彭，T。；聂，Q。 相关软件： 霍普兰；CancerInSilico；强制Atlas2 主要字段： 偏微分方程（35-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）
SignaLink（签名链接） 1份文件引用(2018) 软件作者： Fazekas D、Koltai M、Türei D等人 相关软件： 动态记录仪；gplots；阴性… 主要字段： 生物学和其他自然科学（92-XX）
TFExplorer（TFExplorer） 1份文件引用(2009) 软件作者： Jinsoo Kim、Jungmin Seo、Young Seek Lee、Sangsoo Kin 相关软件： JASPAR；TRANSFAC公司；脚印机 主要字段： 组合数学（05-XX）；运筹学、数学规划（90-XX）；生物学和其他自然科学（92-XX）