J种WS swMATH ID: 37890 软件作者： Richter M、Rosselló-Móra R、Oliver Glöckner F、Pepplies J 描述： JSpeciesWS：基于成对基因组比较的原核生物物种界定网络服务器。摘要：JSpecies Web Server（JSpeciesWS）是一种用户友好的在线服务，用于在电子计算机上计算两个基因组之间的一致程度，这是多相微生物物种界定过程中经常使用的参数。该服务基于BLAST+（ANIb）和MUMmer（ANIm）测量平均核苷酸同一性（ANI），以及四核苷酸签名（tetra）的相关指数。此外，它还提供了四相关搜索功能，可以将选定的基因组与当前约32个不断更新的参考数据库进行快速比较 000份已发布的完整和草图基因组序列。为了进行比较，可以上传自己的基因组，也可以从JSpeciesWS参考数据库中选择参考。这项服务表明两个基因组是否在包含阈值的物种之上或之下共享基因组身份，并作为在迄今已测序物种的框架中分配未知基因组的快速方法。可用性和实现：JSpeciesWS位于http://jspecies.ribohost.com/jspecies网站。 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/32/6/929/1744508 相关软件： 外部斜坡；TTA猞猁；大坝7；CodonW公司；CodonPhyML（密码物理ML）；ntCard（nt卡）；ACUA公司；PAML公司；密码测试；ALF公司；xREI公司；RevTrans公司；MACSE公司；简易代码ML；壁画；标准AIcalc；GCUA公司；CAIcal公司；INCA公司；框架图；TETRA公司 引用于： 1文件 2位作者引用 1 玛丽亚·安尼西莫娃 1 博丹奥斯塔什 0连载引用 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文