雏菊 swMATH ID: 9059 软件作者: 朱塞皮娜·贝鲁、玛丽亚·皮亚·萨科马尼、斯蒂芬妮娅·奥多利、莱昂蒂娜·达朗戈 描述: 雏菊:一种新的软件工具,用于测试生物和生理系统的全局可识别性。先验全局可识别性是生物和生理模型的一种结构属性。它被认为是良好估计的先决条件,因为它涉及在理想条件下(无噪声观测和无误差模型结构)从测量的输入输出数据中唯一恢复未知模型参数的可能性。当然,在投入资源、时间和精力进行实际的生物医学实验之前,确定是否可以从观测数据中唯一地恢复参数是至关重要的。许多有趣的生物模型都是非线性的,但非线性系统的可识别性分析是一个困难的数学问题。文献中提出了不同的方法来测试非线性模型的可识别性,但据我们所知,迄今为止还没有提出用于自动检查非线性模型可识别性的软件工具。本文描述了一个实现微分代数算法的软件工具,用于对多项式或有理方程描述的(线性和)非线性动态模型进行参数可识别性分析。我们的目标是为生物研究人员提供一个完全自动化的软件,需要最少的数学建模知识,并且不需要深入了解数学工具。DAISY(微分代数用于SYstems的可识别性)软件在生物建模研究中可能有用,特别是在生理学和临床医学中,因为在这些领域的研究实验特别昂贵和/或难以执行。本文给出了软件工具DAISY的实际使用示例。DAISY可在网站上找到网址:http://www.dei.unipd.it/~pia/。 主页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17707944 相关软件: 西安;COMBOS公司;GenSSI公司;叶片;可观察性测试;github;枫树;科帕西;阿米戈;波特车轮;MESSI公司;差速器2;朱莉娅;克罗内克;斯坦;parest_dae;CVODE公司;Matlab公司;fminsearch公司;蟒蛇 引用于: 71文件 全部的 前5名187位作者引用 7 尼科莱特·梅什卡特 6 Necibe调谐器 4 保罗·D·多尔蒂。 4 玛丽莎·艾森伯格。 4 海瑟·A·哈灵顿。 4 谢尔盖·伊戈列维奇·卡巴尼钦 4 Olga I·克里沃罗特科。 4 Gleb A.波古丁。 三 杰弗里·蔡斯 三 约瑟夫·迪斯特法诺 三 玛亚·马尔切娃 三 阿列克谢·伊戈列维奇·奥夫钦尼科夫 三 Shiu,Anne(安妮·休) 2 克里斯·安德森。 2 杰拉尔多·乔维尔 2 吉尔斯·克莱蒙特 2 格罗斯,伊丽莎白 2 克里斯托弗·汉恩。 2 加布里埃拉·杰罗尼莫 2 托马斯·Mrziglod 2 安德烈亚斯·舒伯特。 2 巴勃罗·索莱诺 2 卡尔·托马塞思 2 亚历杭德罗·费尔南德斯·维拉弗德 1 南卡罗来纳州阿克曼。 1 Andornaya,D.V.公司。 1 斯蒂恩·安德烈森 1 克里斯托夫·奥布伦 1 斯蒂芬妮娅·奥多利 1 露丝·伊丽莎白·贝克 1 朱利奥·班加。 1 朱塞皮纳·贝鲁 1 萨拉·贝尔托米厄 1 伊利亚斯·比利奥尼斯 1 Bortner,现金 1 特雷弗·鲍曼 1 马蒂奥·布里利 1 爱德华·P·布朗。 1 Buitenweg,Jan R。 1 海伦·玛丽·伯恩 1 文森特·坎纳塔罗。 1 马科斯·卡皮斯特兰。 1 迈克尔·查佩尔。 1 程华 1 朱莉娅·奇夫曼 1 辛奎马尼,尤金尼奥 1 尼古拉斯·康登。 1 卡马拉州达达索娃 1 苏希玛·达哈尔 1 莱昂蒂娜·达安戈 1 西尔维亚·道恩 1 肖恩·戴维森(Shaun M.Davidson)。 1 Hidde德容 1 Domitilla的Del Vecchio 1 德尔·莫纳切(Delle Monache)、玛丽亚·劳拉(Maria Laura) 1 霍尔格·迪达姆 1 罗伯特·J·多尔。 1 董瑞文 1 艾米莉·杜弗雷纳 1 邓森,大卫·布莱恩 1 雪莉·J·戴克。 1 尼尔·D·埃文斯。 1 Cecília S.费尔南德斯。 1 Liam M.菲斯克。 1 《福布斯》、惠特尼 1 福斯,克里斯蒂安 1 塞斯·格伯丁 1 克里斯蒂安·古德布雷克 1 西奥多·格伦伯格。 1 海瑞·古尔布达克 1 比约恩·哈夫克 1 Mansoor A.Haider。 1 汉密尔顿,尼古拉斯·A。 1 简·哈塞纳尔 1 Michael A.L.Hayashi。 1 Hoon Hong 1 瓦莱丽·豪尔 1 胡宝刚 1 伊利亚·伊尔默 1 婴儿,Juan-Antonio 1 哈什·瓦尔丹·贾恩 1 Janzén、David Lars Ivan 1 Jirstrand,Mats公司 1 詹姆斯·约翰卓(James E.Johndrow)。 1 米歇尔·乔伊纳。 1 丹尼尔·卡恩(Daniel S.Kahn)。 1 Kim,Peter S。 1 克里斯,阿里尔 1 安德烈·科奇(Andrzej Kociȩcki) 1 马钦·科拉萨 1 阿达什·昆巴里 1 布莱恩·拉巴雷 1 蒂莫西·兰伯顿。 1 莱因哈德·劳本巴赫(Reinhard C.Laubenbacher)。 1 Joost劳尔斯 1 Le,Trang T。 1 Lee,Peter P。 1 本杰明·莱瑟姆 1 波蒂亚·莱瑟姆。 1 Daniel A.Lichtblau。 …还有87位作者 全部的 前5名33连载 15 数学生物科学 8 数学生物学通报 6 理论生物学杂志 5 数学生物学杂志 2 计算数学和数学物理 2 蒙特卡罗方法及其应用 2 复杂性 2 工程中的数学问题 2 数学生物科学与工程 2 生物动力学杂志 1 生物控制论 1 应用力学与工程中的计算机方法 1 纯粹数学与应用数学交流 1 线性代数和多线性代数 1 计量经济学杂志 1 凯贝内提卡 1 应用数学进展 1 物理D 1 符号计算杂志 1 神经计算 1 应用数学建模 1 SIAM应用数学杂志 1 SIAM审查 1 工程、通信和计算中的应用代数 1 国际鲁棒非线性控制杂志 1 非线性动力学 1 混乱 1 西比尔斯基(Zhurnal Vychislitel’no)马特马提基(Matematiki) 1 SibirskiĭZhurnal Industrial’noĭ·马特马提基 1 非线性科学与数值模拟中的通信 1 国际应用数学与计算机科学杂志 1 SIAM应用动力系统杂志 1 SIAM应用代数和几何杂志 全部的 前5名19个领域引用 55 生物学和其他自然科学(92-XX) 21 系统论;控制(93至XX) 15 常微分方程(34-XX) 7 统计学(62-XX) 5 场论和多项式(12-XX) 5 交换代数(13-XX) 5 数值分析(65-XX) 2 组合数学(05-XX) 2 动力系统和遍历理论(37至XX) 2 概率论与随机过程(60-XX) 2 计算机科学(68至XX) 2 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学(91-XX) 1 代数几何(14-XX) 1 偏微分方程(35-XX) 1 差分方程和函数方程(39至XX) 1 变分法与最优控制;最优化(49至XX) 1 代数拓扑(55-XX) 1 可变形固体力学(74-XX) 1 经典热力学,传热(80-XX) 按年份列出的引文