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SPy排序

swMATH ID: 27042
软件作者: 克里斯托夫·波扎特(Christophe Pouzat,Georgios Is.Detorakis)
描述: SPySort:使用Python进行神经元尖峰排序。用多电极阵列进行细胞外记录是当代神经科学的基本工具之一。这些记录主要用于监测许多单个神经元的活动,即发射的动作电位序列。但细胞外记录产生的原始数据通常是几个神经元活动的混合物。为了获得单个贡献神经元的活动,需要一个称为棘波分类的预处理步骤。我们在这里展示了一个经过良好测试的spike排序过程的纯Python实现。后者是以模块化的方式设计的,以便于从交互式排序(例如使用IPython)平稳过渡到自动排序。令人惊讶的是,将我们现在已经使用了15年的过程重新编码到Python中,这是方法学的重大改进。
主页: https://arxiv.org/abs/11412.6383
源代码:  https://github.com/gdetor/SPySort网站
依赖项: 蟒蛇
关键词: arXiv_cs。总工程师神经元与认知arXiv_q-bio.NC蟒蛇群集抽样定理采样抖动校正尺寸缩减E-M算法高斯混合模型K均值
相关软件: STAR公司IPython公司马特普洛特利布数字PyScikit公司GGobi公司蟒蛇
引用于: 1文件

标准条款

1出版物描述软件 年份
SPySort:使用Python进行神经元尖峰排序arXiv公司
克里斯托夫·波扎特(Christophe Pouzat,Georgios Is.Detorakis)
2014

连载1篇

1 数学应用学报

按年份列出的引文