扇区 swMATH ID: 12606 软件作者： Wicker N、Perrin GR、Thierry JC、Poch O 描述： Secator：从系统发育树推断蛋白质亚家族的程序。随着蛋白质数据的大量增加，一个重要的问题是在一个大的蛋白质家族中估计敏感子集的数量，以便随后进行深入的结构、功能和进化分析。为了解决这个问题，我们开发了一个新程序Secator，它使用基于蛋白质序列多重比对的距离矩阵实现了升序层次方法的原理。通过引入一个新的停止规则来自动确定显著差异值，从而对指定给推导出的系统发育树节点的差异值进行划分。Secator获得的集群质量通过单独的Jackknife研究进行验证。该方法在24个大蛋白家族上进行了验证，涵盖了广泛的结构和序列保守性，在两个研究良好的蛋白家族（Sm蛋白和核受体）上说明了它的实用性和准确性。 主页： http://mbe.oxfordjournals.org/content/18/8/1435.short（短） 相关软件： MSVM包；UCI-毫升；集群；爆炸；ProClust公司；记分员；PSI-爆炸；肌肉；ClustalW公司；MAFFT公司 引用于： 1文件 2位作者引用 1 亚历杭德罗·穆拉。 1 尼古拉斯·威克 连载1篇 1 计算统计学 在1个字段中引用 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文