MDR公司 swMATH编号: 22494 软件作者: 哈恩·L·W。;里奇医学博士。;摩尔·J·H。 描述: 用于检测基因-基因和基因-环境相互作用的多因素降维软件。动机:人类基因的多态性被大量描述。确定哪些多态性和哪些环境因素与常见、复杂疾病相关已成为一项艰巨的任务。这部分是因为任何单一遗传变异的影响可能取决于其他遗传变异(基因-基因相互作用或上位性)和环境因素(基因-环境相互作用)。检测和表征多个因素之间的相互作用是一项统计和计算挑战。为了解决这个问题,我们开发了一种多因素降维(MDR)方法,用于将高维遗传数据分解为单个维度,从而允许在相对较小的样本大小中检测相互作用。在本文中,我们描述了MDR方法和MDR软件包。结果:我们开发了一个程序,将MDR与交叉验证策略相结合,用于估计多因素模型的分类和预测误差。该软件可用于分析2-15个遗传和/或环境因素之间的相互作用。数据集可能包含多达500个总变量和最多4000个研究对象。可用性:有关获取可执行代码、示例数据、示例分析和文档的信息可根据要求提供。联系人:moore@phg.mc.vanderbilt.edu补充信息:所有补充信息可在http://phg.mc.vanderbilt.edu/Software/MDR。 主页: http://www.multipatordimensionalityreducation.org/ 相关软件: 减压阀F;SNP统计;逻辑FS;plspm公司;PLINK公司;cpvSNP公司;MixMAP软件;电子交易管理局;SKAT公司;事实矿工;aSPU公司;科恩拉布;阿德根特;Postgwas公司;SNPassoc公司;GWA工具;生物导体;卢比;迁移率;snpStats(snpStat) 引用于: 5文件 全部的 前5名被29位作者引用 1 内特·巴尼 1 曹、贾 1 陈巴东 1 蒋福田 1 庄丽叶 1 克劳迪娅·法西诺 1 乔舒亚·吉尔伯特(Joshua C.Gilbert)。 1 菲尔·汉隆 1 托德·霍尔顿 1 李、田 1 李婷婷 1 安迪·洛伦茨 1 马图洛(G.Matullo)。 1 Jason H·摩尔。 1 Ricceri,F。 1 玛格丽塔·罗杰罗 1 利亚·特拉奇尼 1 玛丽亚·卢拉·托伦特 1 蔡嘉提 1 保罗·维奈斯 1 比尔·C·怀特。 1 邢磊 1 杨成红 1 杨怀硕 1 杨欢 1 曾、韩 1 张乐 1 郑春秋 1 周子元 3篇连载文章中引用 3 理论生物学杂志 1 复杂性 1 自然现象的数学建模 在5个字段中引用 5 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 统计学(62-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文