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beadarray公司

swMATH ID: 6092
软件作者: 马克·邓宁(Mark J.Dunning)。;娜塔莉·索恩(Natalie P.Thorne)。;伊莎贝尔·卡米利尔;迈克尔·L·史密斯。;西蒙·塔瓦尔埃
描述: Illumina BeadArrays的质量控制和低水平统计分析Illumina BeadArray平台是一种基于随机组装的珠子阵列的新型微阵列技术。阵列上的每个珠子携带单个基因特异性探针的副本,平均每个珠子类型在一个阵列上约有30个副本。鉴于BeadArray数据再现性方面的令人鼓舞的结果,以及已经使用BeadArray技术进行的高调研究,可用的BeadArra数据量可能会增加。BeadArray技术的一个主要优点是可以高度复制给定类型的珠子。然而,当前的分析方法将每个珠子类型的汇总信息作为输出,而不是阵列上每个单个珠子的信息。beadarray R包能够使用原始图像作为输入,为阵列重新创建单个珠子信息。在这里,我们使用一个特定的实验来说明Illumina使用的图像处理步骤以及beadarray中可用的相应方法。我们对BeadArray数据的研究表明,阵列内部和阵列之间具有高度的再现性。然而,我们发现了低级分析中一些可以改进的方面。
主页: http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/beadarray.html
关键词: Illumina公司;串珠阵列;生物导体;微阵列
相关软件: R(右);生物导体;卢米;利马;beadarray示例数据;beadarray过滤器;边缘R;去噪;Refplus公司;TM4公司;单通道图形用户界面;全球气候变化评估;地理查询;BRLMM公司;寡聚物;彪马;Affycomp III公司;阿菲
引用于: 3文件

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