隔间 swMATH ID: 29372 软件作者： 活页夹JX、Pletscher-Frankild S、Tsafou K、Stolte C、O'Donoghue SI、Schneider R、Jensen LJ 描述： 隔间：蛋白质亚细胞定位证据的统一和可视化。蛋白质亚细胞定位信息对于理解蛋白质的细胞功能非常重要。目前，这些信息是从文献中手动收集的，从高通量的基于显微镜的屏幕上获得，并从一级序列中预测。因此，为了全面了解蛋白质的定位，有必要查阅多个数据库和预测工具。为了解决这个问题，我们提供了COMPARTMENTS资源，它集成了上面列出的所有源以及自动文本挖掘的结果。资源与源数据库自动保持最新，所有定位证据都映射到通用蛋白质标识符和基因本体术语上。我们进一步为本地化证据分配置信度得分，以便于比较不同类型和来源的证据。为了进一步提高可比性，我们根据本地化证据的类型和来源分配置信度得分。最后，我们将蛋白质在示意细胞上的统一定位证据可视化，以提供简单的概述。数据库URL:http://compartments.jensenlab.org 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3935310/ 相关软件： 生物网格；蜘蛛2；动态记录仪；gplots（gplots）；黑人；矩阵数据库；内部数据库；HuPho公司；miRNet（miRNet）；小队；吉梅纳；线索GO；全球气候变化评估；雷德（Rede R）；字符串db；阿尼莫；PRS公司；网络同步；SMPDB公司；路径蜂窝网 引用于： 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 阿尔贝托·桑托斯·德尔加多 1 高建钊 1 阮吉首 1 路易丝·冯·斯特肖 1 吴方祥 1 张兆鹏 2篇连载文章中引用 1 理论生物学杂志 1 分子生物学方法 在1个字段中引用 2 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文