SILGGM公司 swMATH ID: 40575 软件作者: 张荣、赵仁、魏晨 描述: R包SILGGM:基因网络中大尺度高斯图形模型的统计推断。提供了一个通用框架,使用众所周知的高斯图形模型(GGM)以高效的方式对每个基因对进行统计推断,并对基因网络中的全尺度基因对进行全局推断。我们关注高维设置,其中p(基因数量)允许远远大于n(受试者数量)。该软件包支持四种主要方法:(1)双变量节点缩放Lasso(Ren et al(2015)<doi:10.1214/14-AOS1286>)(2)去稀疏化节点缩放Lasso(Jankova和van de Geer(2017)<doi:10.1007/111749-016-503-5>)(3)去稀疏化图形Lasso(Jankova和van de Geer(2015)<doi:10.1214/15-EJS1031>)(4)使用缩放的Lasso或Lasso(Liu(2013)<doi:10.1214/13-AOS1169>),利用错误发现率控制(FDR)进行GGM估计。Windows用户应在安装此软件包之前安装“Rtools”。 主页: https://cran.r-project.org/web/packages/SILGGM/index.html 源代码: https://github.com/cran/SILGGM网站 依赖项: R(右) 相关软件: 玻璃制品;ppcor公司;深粉红色;KnockoffGAN公司;范围;跨栏跑普通;Pathway公用地;CRASP公司;PSICOV公司;跳跃;测试BMN;ToppGene套件;DEseq公司;巨大的 引用于: 5文件 全部的 前5名18位作者引用 2 任,赵 1 胡安·塞利登。 1 陈伟 1 戴、晨光 1 贾克绝 1 李道基 1 李阳 1 林步友 1 刘建宇 1 刘军S。 1 刘玉峰 1 孙伟 1 王浩东 1 Xing、Xin 1 张荣 1 郑泽民 1 周,贾 1 周、文 3篇连载文章中引用 2 美国统计协会杂志 2 应用统计学年鉴 1 多元分析杂志 在2个字段中引用 5 统计学(62-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文