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SILGGM公司

swMATH ID: 40575
软件作者: 张荣、赵仁、魏晨
描述: R包SILGGM:基因网络中大尺度高斯图形模型的统计推断。提供了一个通用框架,使用众所周知的高斯图形模型(GGM)以高效的方式对每个基因对进行统计推断,并对基因网络中的全尺度基因对进行全局推断。我们关注高维设置,其中p(基因数量)允许远远大于n(受试者数量)。该软件包支持四种主要方法:(1)双变量节点缩放Lasso(Ren et al(2015)<doi:10.1214/14-AOS1286>)(2)去稀疏化节点缩放Lasso(Jankova和van de Geer(2017)<doi:10.1007/111749-016-503-5>)(3)去稀疏化图形Lasso(Jankova和van de Geer(2015)<doi:10.1214/15-EJS1031>)(4)使用缩放的Lasso或Lasso(Liu(2013)<doi:10.1214/13-AOS1169>),利用错误发现率控制(FDR)进行GGM估计。Windows用户应在安装此软件包之前安装“Rtools”。
主页: https://cran.r-project.org/web/packages/SILGGM/index.html
源代码:  https://github.com/cran/SILGGM网站
依赖项: R(右)
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引用于: 5文件

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