拉索蛋白 swMATH ID: 42314 软件作者： 黄，T。；龚，H。；杨，C。；他，Z 描述： 蛋白质拉索：鸟枪蛋白质组学中蛋白质推断问题的拉索回归方法。蛋白质推断是蛋白质组学研究中的一个重要问题。其主要目的是选择合适的候选蛋白质子集，以最好地解释观察到的肽。尽管已经提出了许多方法来解决这个问题，但诸如肽简并和一击奇观等几个问题仍然没有解决。因此，准确鉴定样品中真正存在的蛋白质仍然是一项具有挑战性的任务。基于肽可检测性的概念，我们将蛋白质推理问题描述为一个约束拉索回归问题，通过坐标下降过程可以非常有效地解决该问题。新的推理算法被命名为ProteinLasso，它探索了一种集成学习策略来解决Lasso模型中的稀疏参数选择问题。我们在三个数据集上测试ProteinLasso的性能。如实验结果所示，ProteinLasso在识别准确性和运行效率方面都优于那些最先进的蛋白质推理算法。此外，我们还表明ProteinLasso在不同的参数规范下是稳定的。我们算法的源代码可从以下网址获得：http://sourceforge.net/projects/proteinasso。 主页： https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1476927113000029 源代码： https://sourceforge.net/projects/proteinasso/files网站/ 相关软件： 约束拉索;备用注册;吉拉索;朱莉娅;ggplot2;对;Matlab公司;iPiano公司 引用于： 3文件 全部的 前5名7位作者引用 1 基兰莫·达斯 1 布莱恩·盖恩斯（Brian R.Gaines）。 1 Kim，Juhyun先生 1 尼马纳，尼米特 1 佩特罗，纳林 1 马克·索贝尔（Marc J.Sobel）。 1 周，华 3篇连载文章中引用 1 全球优化杂志 1 统计建模 1 计算与图形统计杂志 在4个字段中引用 2 统计学（62-XX） 1 算子理论（47-XX） 1 数值分析（65-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文