共享2 swMATH ID: 36923 软件作者: 村上洋一、苏珊·琼斯 描述: SHARP2:使用斑块分析预测蛋白质-蛋白质相互作用。SHARP2是一种灵活的基于网络的生物信息学工具,用于预测蛋白质结构上潜在的蛋白质-蛋白质相互作用位点。它实现了一种预测算法,可以计算蛋白质表面重叠残基斑块的多个参数。计算了六个参数:溶剂化势、疏水性、可及表面积、残余界面倾向、平面度和凸出度(SHARP2)。将每个补丁的参数得分进行组合,并将组合得分最高的补丁预测为潜在的交互位置。SHARP2允许用户上传PDB格式的3D蛋白质结构文件,以下载HTML表的形式获取潜在交互站点的信息,并使用Jmol查看3D结构上站点的位置。服务器允许输入多个结构和多个参数组合。因此,可以对完整的数据集以及单个结构进行预测。 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/22/14/1794/227272 相关软件: 元-PPISP;氢气 引用于: 1文件 1位作者引用 1 罗曼·尤里克·阿斯珀 0连载引用 在4个字段中引用 1 统计学(62-XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 信息与通信理论、电路(94-XX) 按年份列出的引文