PMS6MC系列 swMATH ID: 28061 软件作者： Bandyopadhyay，Shibdas；萨赫尼，萨尔塔吉；桑古瑟瓦·拉贾塞卡兰 说明： PMS6MC：用于模体发现的多核算法。我们为（l，d）-模体发现问题开发了一个高效的多核算法PMS6MC，在该算法中，我们要找到出现在给定字符串集的每个字符串中的所有长度为l的字符串，其中最多有d个不匹配项。PMS6MC基于PMS6，PMS6是目前在大型实例中发现模体最快的单核算法。相对于PMS6，我们的多核算法实现的加速比范围从（17.6）个具有挑战性的实例的高6.62到Intel 6核系统上（13.4）个具有质疑性的实例低2.75。我们估计PMS6MC在大型实例上的motif搜索速度是其他并行算法的2到4倍。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4193679/ 关键词： 种植基序搜索;并行字符串算法;多核算法 引用于： 0个文档