Abs过滤器GSEA swMATH ID: 16591 软件作者: 索拉·尹 描述: R包AbsFilterGSEA。基因集富集分析(GSEA)广泛用于评估预定义基因集中差异信号的富集,而不使用差异表达的截止阈值。通过样品或基因突变法评估富集的重要性。尽管样本置换方法由于其良好的假阳性控制而被强烈推荐,但如果样本数量较少,我们必须使用基因置换方法。然而,随着每个基因组中基因间相关性的增加,这种基因置换GSEA(或预先排序的GSEA)会产生大量假阳性基因。通过使用单尾绝对GSEA结果进行过滤,可以成功地减少这些假阳性。这个软件包提供了一个函数,可以在有或没有绝对过滤的情况下执行基因验证GSEA计算。如果没有过滤,用户可以执行(原始的)双尾或单尾绝对GSEA。 主页: https://cran.r-project.org/web/packages/AbsFilterGSEA/index.html 源代码: https://github.com/cran/AbsFilterGSEA网站 依赖项: R(右) 关键词: 起重机;R包;基因富集分析;GSEA公司 引用于: 0个文档