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maskmeans公司

swMATH ID: 35561
软件作者: 戈迪孔·巴吉奥尼(Godichon-Baggioni),安托万(Antoine);Maugis-Rabusseau,Cathy;安德烈亚·劳
描述: 多视图聚类聚集和分裂,应用于多组乳腺癌数据。多视图数据代表不同但相关的变量组,有助于确定观测值之间的相关且稳健的聚类结构。在计算机科学和基因组学领域提出了大量的多视图分类算法;在这里,我们转而关注基于多视图数据合并或拆分现有的硬集群分区或软集群分区的任务。这篇文章是由一个涉及来自癌症基因组图谱的多组乳腺癌数据的应用程序特别激发的,其中包含多个分子图谱(基因表达、microRNA表达、甲基化和拷贝数改变)用于将目前公认的五种固有肿瘤亚型进一步细分为不同的患者亚组。此外,我们在一组仿真中研究了所提出的多视图分割和聚合算法与单视图和级联视图方案相比的性能。这里开发的多视图分割和聚合算法在maskmeans R包中实现。
主页: https://github.com/andreamrau/maskmeans网址
源代码:  https://github.com/andreamrau/maskmeans网址
关键词: 群集多视图簇合并和分裂多元数据TCGA公司
相关软件: fclust公司JIVE公司MVDA公司复杂热图卡普塞ggplot2
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1 统计学(62-XX)

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