CBPM曲率和单元格指南 swMATH编号: 38893 软件作者: Hegarty-Cremer,Solene G.D。;马修·辛普森(Matthew J.Simpson)。;安徒生,托马斯·L。;帕斯卡尔·布恩兹利。 描述: 模拟进化生物组织中的细胞导向和曲率控制。组织几何形状对许多生物组织的进化具有重要影响。进化组织的局部曲率会导致组织拥挤或扩散,从而导致不同的组织生长速度,并导致细胞张力的变化,从而影响细胞行为。在这里,我们研究了定向细胞运动如何与进化中的生物组织中的曲率控制相互作用。定向细胞运动涉及组织成角生长和各向异性组织材料属性(例如组织纤维方向)的生成。我们开发了一种新的基于细胞的组织生长数学模型,其中包括曲率控制和细胞引导机制,以研究它们之间的相互作用。该模型基于应用于组织运动边界处或附近的组织合成细胞密度的守恒原理。由此产生的数学模型是一个关于移动边界上细胞密度的偏微分方程,该方程使用称为基于细胞的粒子方法的混合前跟踪方法进行数值求解。包含定向细胞运动使我们能够模拟新类型的生物生长,其中切向细胞运动对于界面的演化或各向异性组织属性的生成非常重要。我们通过应用该模型来模拟骨重塑过程中的吸收和填充成分,以及模拟根毛生长,来说明这种情况。我们还提供了用户友好的MATLAB代码来实现算法。 主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0022519321000801 源代码: https://github.com/SoleneHC/CBPM_curvature_and_cell_guidence网站 依赖项: Matlab公司 关键词: 组织生长;骨骼重塑;组织工程;表面活性剂;移动边界问题 相关软件: github;NLopt(NLopt);pllf公司;中性PDE.jl;微分方程.jl;朱莉娅;图像处理工具箱;BOBYQA公司;FronTier公司;Matlab公司 引用于: 2文件 标准文章 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 模拟进化生物组织中的细胞导向和曲率控制。 Zbl 1465.92012年Hegarty-Cremer,Solene G.D.公司。;马修·辛普森。;托马斯·安德森。;帕斯卡尔·布恩兹利。 2021 全部的 前5名被9位作者引用 2 帕斯卡尔·布恩兹利。 2 马修·辛普森。 1 马克·艾伦比。 1 托马斯·安德森。 1 亚历山大·勃朗宁(Alexander P.Browning)。 1 Hegarty-Cremer,Solene G.D.公司。 1 马修·拉纳罗 1 奥利弗·麦克拉伦。 1 玛丽亚·伍德拉夫。 连载1篇 2 理论生物学杂志 在2个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 偏微分方程(35-XX) 按年份列出的引文