LncmiRSRN公司 swMATH ID: 34139 软件作者： 张杰。；刘，L。；李，J。；Le，T.D。 描述： LncmiRSRN：鉴定和分析人类癌症中长非编码RNA相关miRNA海绵调节网络。结果：我们提出了一种新的方法，通过将匹配的lncRNA和mRNA表达谱与临床信息和推测的miRNA-靶相互作用相结合，构建lncRNA相关的miRNA海绵调节网络（LncmiRSRNs）。利用该方法，我们构建了四种人类癌症（多形性胶质母细胞瘤、肺癌、卵巢癌和前列腺癌）的LncmiRSRNs。基于这些网络，我们发现在从miRNA控制释放后，目标mRNA通常被海绵lncRNA上调，只有一小部分海绵lncRNA-mRNA调控关系和中枢lncRNA被四种癌症共享。此外，大多数海绵lncRNA-mRNA调节关系在不同癌症之间显示出重新连接模式，少数在不同癌症中保守（出现）的海绵lncRNA调节关系可能是跨癌症的共同支点。此外，差异和保守的中枢lncRNA可能是潜在的癌症驱动因素，影响癌症的癌变状态。功能富集和生存分析表明，识别出的差异和保守的LncmiRSRN网络模块作为生物过程中的功能单元，可以区分癌症的转移风险。我们的分析显示了整合表达谱、临床信息和miRNA-靶相互作用来研究lncRNA调控机制的潜力。 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/4232/5046259 源代码： https://github.com/zhangjupeng411/LncmiRSRN 相关软件： 塔皮尔；psRNA目标 引用于： 1文件 由4位作者引用 1 伊斯马利亚，布巴 1 康强 1 栾玉石 1 孟军 连载1篇 1 数学生物科学 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文