鲁比克 swMATH ID: 30094 软件作者： Y.Wang、R.Chen、J.Ghosh、J.C.Denny、A.Kho、Y.Chen、B.A.Malin、J.Sun 描述： Rubik：健康数据分析的知识引导张量分解和完成。计算表型是将异构电子健康记录（EHR）转换为有意义的临床概念的过程。无监督表型分析方法有潜力利用大量标记EHR数据进行表型发现。然而，现有的无监督表型分析方法并没有结合当前的医学知识，无法直接处理缺失或噪声数据。我们提出了Rubik，一种用于表型分析的约束非负张量因子分解和完成方法。Rubik包含了1）指导约束以与现有医学知识保持一致，以及2）成对约束以获得不同的、不重叠的表型。Rubik还具有内置的张量补全功能，可以显著减轻噪声和缺失数据的影响。我们利用乘数交替方向法（ADMM）框架进行张量分解和完成，这可以通过并行计算轻松缩放。我们在两个EHR数据集上评估了Rubik，其中一个包含7744名门诊患者的647118条记录，另一个是包含472645名患者的1018614条CMS索赔记录的公共数据集。我们的结果表明，与基线相比，Rubik可以发现更多有意义和独特的表型。特别是，通过使用知识指导约束，Rubik还可以发现几种主要疾病的亚表型。Rubik的运行速度也是当前最先进的张量方法的7倍左右。最后，Rubik可扩展到包含数百万EHR记录的大型数据集。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6709413/ 相关软件： SDPLR公司；Genten公司；github；Matlab公司；DFacTo公司；分裂；弗罗斯特；理想配偶；Vc公司；科科斯；算法862；张量工具箱 引用于： 2文件 4位作者引用 1 穆罕默德·易卜拉欣（Mohamed Ibrahim Assoweh） 1 塔玛拉·吉布森·科尔达 1 埃里克·T·菲普斯。 1 布拉希姆·塔马达兹特 2篇连载文章中引用 1 计算与应用数学杂志 1 SIAM科学计算杂志 在2个字段中引用 2 线性代数和多线性代数；矩阵理论（15-XX） 2 数值分析（65-XX） 按年份列出的引文